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학위논문 상세정보

스팟 윤곽의 기울기를 이용한 단백질 2차원 전기영동 영상에서의 스팟 검출 방법 원문보기
(A) Spot Detection Method in 2D Electrophoresis Images Using Gradients of Spot Boundary

  • 저자

    유혜경

  • 학위수여기관

    고려대학교 대학원

  • 학위구분

    국내석사

  • 학과

    컴퓨터학과

  • 지도교수

  • 발행년도

    2004

  • 총페이지

    ⅴ, 37p.

  • 키워드

    스팟윤곽 단백질 전기영동;

  • 언어

    kor

  • 원문 URL

    http://www.riss.kr/link?id=T10072008&outLink=K  

  • 초록

    2003년, 인간 게놈 프로젝트(Human Genome Project)를 통해 인간 게놈 지도가 완성된 후 인간 유전체 정보를 기반으로 한 후기 유전체학(Post-genomics)이 등장했다. 후기 유전체학의 다양한 분야 중 하나인 단백질체학의 발전에 기여를 한 단백질 2차원 전기영동 실험은 단백질 분리 방법 중 가장 널리 쓰이는 방법이다. 이 실험을 통해서 한 세포 내에서의 단백질 발현 정도나 변형 상태 등을 총체적으로 비교 가능하며 이러한 정보를 바탕으로 각종 질병의 발생원인, 진행 상태, 생리적인 변화 등에 대해 분석 할 수 있다. 단백질 분석은 인류의 질병 정복에 많은 도움이 될 수 있음에도 불구하고 지금까지 실험이 자동화되지 못했고, 단백질 2차원 전기영동 실험 영상 분석 단계에서도 병목 현상이 일어나고 있다. 특히 단백질 2차원 전기영동 실험 영상의 분석 과정 중 단백질 스팟 검출 과정은 정확히 새로운 단백질을 발견하기 위한 중요한 단계로써 생물학적인 특성을 가지는 영상에서 단백질 스팟을 검출하는 과정이다. 본 논문에서는 자동화된 단백질 스팟 검출 방법과 복잡한 스팟 영역에 대해서 스팟의 형태 정보를 이용하여 스팟 개수 추정 및 분리를 수행함으로써 신뢰성 있는 단백질 스팟 정량화 방법을 제안하고자 한다. 영상에서 스팟 후보 영역을 추출한 후, 윤곽의 기울기를 이용하여 스팟 개수를 추정 및 분리하는 방법이다. 단백질 2차원 전기영동 영상 분석 소프트웨어 EasyPro, Z3 그리고 Melanie를 이용한 결과 비교와 성능 비교 평가에서, 겹친 정도가 60%를 넘는 인공 스팟을 이용한 실험 결과 기존 방법에 비해 우수한 결과를 보인다. 단백질 기능을 밝히는 것의 중요성이 대두되면서 그 유용성이 높아지고 있지만, 단백질 2차원 전기영동 실험은 아직 기술적인 한계성을 지니고 있다. 앞으로 희소성 단백질 분리의 어려움, 실험 별로 재현성이 떨어져서 발생하는 문제점 등이 보완된다면 질병의 원인 규명, 신약 개발 등을 가속화하는데 기여할 수 있을 것이다.


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