본문 바로가기
HOME> 논문 > 논문 검색상세

논문 상세정보

재조합 DNA probe에 의한 Fusarium oxysporum 분화형간의 분류 및 유전적 변이 분석
Classification and Genetic Variation Analysis Among Formae Speciales of Fusarium oxysporum by Using Recombinant DNA Probes

김영태   (충남대학교 농과대학 농생물학과UU0001302  ); 김홍기   (충남대학교 농과대학 농생물학과UU0001302  );
  • 초록

    재조합 DNA probe를 이용하여 국내 Fusarium oxysporum 분화형간의 분류 가능성을 탐색하고 그들의 유전적 변이를 분석하였다. F. oxysporum f. sp. lycopersici, cucumerinum, fragariae, garlic, sesami 등 5종의 분화형을 공시하여 RFLP 분석을 실시하였다. Repetitive copy clone인 세종의 재조합 클론 pFC46, pFC52, pFC57을 이용하여 HindIII로 처리한 F. oxysporum의 genomic DNA에 대해 southern hybridization한 결과 나타난 밴드의 양상은 분화형에 따라 차이가 명확히 밝혀져 이들을 이용한 분류가 가능하였다. 또한 RFLP 분석 결과 f. sp. sesami는 다른 분화형에 비해 다소 변이가 심했으나 다른 분화형들은 변이가 거의 없어 f. sp. sesami를 제외한 f. sp. lycopersici 등 4종의 Fusarium oxysporum 분화형의 균주들은 채집 지역에 관계없이 대체로 유전적으로 안정되어 있는 것으로 판단되었다. Hybridization밴드의 양상에 기초하여 유전적 유연관계를 집괴 분석한 결과 각 분화형별로 유사도가 매우 높게 별도의 유사군을 형성하였다.


    Five formae speciales of Fusarium oxysporum in Korea were examined using RFLP analysis to find the possibility for classification and analyze genetic variations. DNAs from F. oxysporum f. sp. lycopersici, cucumerinum, fragariae, garlic and sesami were used with three recombinant probes such as pFC46, pFC52 and pFC57. Distinct differences among five formae speciales of this fungus were detected in RFLP band patterns based on southern hybridization of genomic DNA using each recombinant clone, which was a repetitive copy probe. Strains belong to four formae speciales could be very stable in genetic variation except f. sp. sesami which has more variation than the others based on the RFLP analysis. They formed their own cluster which has high similarity within the same formae specialis resulted from the UPGMA analysis for genetic relationship analysis and each cluster represented its own formae specialis. The method using three recombinant DNA probes could be a good tool for classification of formae speciales in F. oxysporum.


  • 주제어

    Fusarium oxysporum .   formae speciales .   recombinant DNA probe .   repetitive copy clone .   genetic variation .   classification.  

  • 참고문헌 (16)

    1. Intraspecific variation within population of Fusarium oxysporum based on RFLP analysis of the intergenic spacer region of the rDNA , Appel, D.;Gordon, T.R. , Exp. Mycol. / v.19,pp.120-128,
    2. An evaluation of F. oxysporum from crucifers based on pathogenicity, isozyme polymorphism, vegetative compatibility and geographic origin , Bosland, P.W.;Williams, P.H. , Can J. Bot. / v.65,pp.2067-2073,
    3. Nitrate nonutilizing mutants of Fusarium oxysporum and their use in vegetative compatibility tests , Correll, J.C.;Klittich, C.J.R.;Leslie, J.F. , Phytopathology / v.77,pp.1640-1646,
    4. Comparison of three molecular methods for the characterization of Fusarium oxysporum strains , Edel, V.;Steinberg, C.;Avelange, I.;Laguerre, G.;Alabouvette, C. , Phytopathology / v.85,pp.579-585,
    5. Population structure of Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici: Restriction fragment length polymorphisms provide genetic evidence that vegetative compatibility group is an indicator of evolutionary origin , Elias, K.S.;Zamir, D.;Lichtman-Pleban, T.;Katan, T. , Mol. Plant-Microbe Inter. / v.6,pp.565-572,
    6. The pathogenecity of race 1 and 2 of Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici , Gerdemann, J.W.;Finley, A.M. , Phytopathology / v.41,pp.238-244,
    7. Occurrence of a third race of Fusarium wilt of tomatoes in Queensland , Grattige, R.;O'Brien, R.G. , Plant Dis. / v.66,pp.165-166,
    8. Potential application of recombinant DNA probes for relatedness analysis of Fusarium oxysporum , Kim, H.G.;Kim, Y.T.;Yu, S.H. , Kor. J. Plant Pathol. / v.10,pp.1-6,
    9. Relatedness of strains of Fusarium oxysporum from Crucifers measured by examination of mitochondrial and ribosomal DNA , Kistler, H.C.;Bosland, P.W.;Benny, U. , Phytopathology / v.77,pp.1289-1293,
    10. Repetitive genomic sequence for determining relatedness among strains of Fusarium oxysporum , Kistler, H.C.;Momol, E.A.;Benny, U. , Phytopathology / v.81,pp.331-336,
    11. Genetic diversity of Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici in restriction fragment length polymorphisms of mitochondrial DNA , Kuninaga, S.;Yokosawa, R. , Trans. Mycol. Soc. Japan / v.33,pp.449-495,
    12. Potential application of random DNA probes and restriction fragment length polymorphisms in the taxonomy of the Fusaria , Manicom, B.Q.;Bar-Joseph, M.;Rosner, A.;Vigodsky-Haas, H.;Kortze, J.M. , Phytopathology / v.77,pp.669-672,
    13. A restriction fragment length polymorphism probe relating vegetative compatibility groups and pathogenicity in Fusarium oxysporum f. sp. dianthi , Manicom, B.Q.;Bar-Joseph, M.;Kortze, J.M.;Bekcer M.M. , Phytopathology / v.80,pp.336-339,
    14. Classification of strains of Fusarium oxysporum on the basis of vegetative compatibility , Puhalla, J.E. , Can. J. Bot. / v.63,pp.179-183,
    15. NTSYS-pc. Numerical taxonomy and multivariate analysis system , Rohlf, F.J. , / v.,pp.,
    16. Molecular Cloning: A Laboratory manual , Sambrook, J.;Fritsch, E.F.;Maniatis, T. , / v.,pp.,

 저자의 다른 논문

  • 김영태 (4)

    1. 1999 "Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici의 Electrophoretic Karyotype" 한국균학회지 = The Korean journal of mycology 27 (2): 112~118    
    2. 1999 "Mycological Characteristics of Fusarium solani f. sp. pisi Isolated from Pea, Ginseng and Soybean in Korea" The plant pathology journal 15 (1): 44~47    
  • 김홍기 (21)

 활용도 분석

  • 상세보기

    amChart 영역
  • 원문보기

    amChart 영역

원문보기

무료다운로드
  • NDSL :
유료다운로드

유료 다운로드의 경우 해당 사이트의 정책에 따라 신규 회원가입, 로그인, 유료 구매 등이 필요할 수 있습니다. 해당 사이트에서 발생하는 귀하의 모든 정보활동은 NDSL의 서비스 정책과 무관합니다.

원문복사신청을 하시면, 일부 해외 인쇄학술지의 경우 외국학술지지원센터(FRIC)에서
무료 원문복사 서비스를 제공합니다.

NDSL에서는 해당 원문을 복사서비스하고 있습니다. 위의 원문복사신청 또는 장바구니 담기를 통하여 원문복사서비스 이용이 가능합니다.

이 논문과 함께 출판된 논문 + 더보기