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한국균학회지 = The Korean journal of mycology v.26 no.2 = no.85, 1998년, pp.135 - 143   피인용횟수: 3

Fusarium속에서 PFGE를 이용한 Electrophoretic Karyotyping
Electrophoretic Karyotyping by PFGE in the Genus Fusarium

민병례    (상명대학교 자연과학대학 생물학과   ); 정진숙    (서울대학교 분자미생물학 연구센타   ); 최영길    (한양대학교 자연과학대학 생물학과  );
  • 초록

    CHEF (Contour-Clamped homogeneous electric field) gel electrophoresis를 이용하여 Fusarium section Sporotrichiella, Liseola, Gibbosum, Discolor와 Martiella에 속하는 10종의 electrophoretic karyotype을 비교하였다. Intact chromosomal DNA는 균류의 원형질체로부터 추출하였으며, 크기에 따라 다양한 조건을 주어 DNA 분자를 분리시켰다. Fusarium속에 속하는 종의 염색체는 0.78Mb에서 7.20Mb의 크기를 가진 염색체가 종에 따라 $5{\sim}13$ 개였다. 각 종의 total genome 크기는 18.32Mb에서 48.20Mb였다. Electrophoretic karyotype을 비교한 후 F. oxysporum formae speciales lilii로부터 무작위로 선택하여 만든 genomic DNA를 probe로 하여 Southern hybridization 분석을 수행하였다.


    Contour-clamped homogeneous electric field gel electrophoresis was used to establish electrophoretic karyotype for 10 species of Fusarium sections Sporotrichiella, Liseola, Gibbosum, Discolor and Martiella. Intact chromosomal DNA was isolated from fungal protoplast and separated under various conditions according to their size in order to improve DNA separation. The numbers of chromosome-sized DNA molecules for individual species ranged from 5-13, with individual chromosomes ranging from 0.78 Mb to 7.20 Mb in size. The total genome DNA size of each species was estimated at about 18.32 Mb to 48.20 Mb. Comparison of karyotype profiles following Southern hybridization analysis with a randomly selected genomic probe of F. oxysporum formae speciales litii was carried out.


  • 주제어

    CHEF .   Electrophoretic karyotype .   Fusarium .   Southern hybridization analysis.  

  • 참고문헌 (22)

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  • 이 논문을 인용한 문헌 (3)

    1. 1999. "Study of Electrophoretic Karyotypes of Fusarium Section Liseola" Korean journal of microbiology = 미생물학회지, 35(3): 192~196     
    2. 1999. "RAPD-PCR Analysis in Fusarium species" Korean journal of microbiology = 미생물학회지, 35(2): 107~114     
    3. 2000. "" The journal of microbiology, 38(2): 66~73     

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    1. 1998 "지하수 세균 군집에 미치는 물리화학적 환경요인의 영향" 지하수환경 = Journal of the Korean Society of Groundwater Environment 5 (4): 215~222    
    2. 1999 "DNA 교잡에 의한 토양 미생물 군집의 다양성과 유사성" 환경생물 = Korean journal of environmental biology 17 (3): 279~284    
    3. 2000 "Identification of a Novel PGE2 Regulated Gene in SNU1 Gastric Cancer Cell" Journal of biochemistry and molecular biology = 한국생화학회지 33 (2): 184~187    
    4. 2000 "PCR-RFLP and Sequence Analysis of the rDNA ITS Region in the Fusarium spp." The journal of microbiology 38 (2): 66~73    
    5. 2000 "지하수 세균 군집의 유전적 다양성" 환경생물 = Korean journal of environmental biology 18 (1): 53~61    
    6. 2001 "지하수에서 분리한 은(銀) 축적균주에 대한 축적조건 및 특성" Korean journal of microbiology = 미생물학회지 37 (4): 273~276    
    7. 2001 "Variation of the Intergenic Spacer (IGS) Region of Ribosomal DNA among Fusarium oxysporum formae Speciales" The journal of microbiology 39 (4): 265~272    
    8. 2001 "Aspergillus sp. HCLF-4에 의해 생성되는 세균세포벽 분해효소의 특성" Korean journal of microbiology = 미생물학회지 37 (1): 15~20    
    9. 2002 "Fusarium section Liseola 균주들에서 rDNA Intergenic Spacer 부위의 PCR-RFLP 분석" Korean journal of microbiology = 미생물학회지 38 (1): 7~12    
    10. 2003 "Reverse dot hybridization 방법과 16S rRNA gene(16S rDNA)을 이용한 식품에서 식중독균의 탐색" 한국식품과학회지 = Korean journal of food science and technology 35 (3): 470~474    
  • 최영길 (68)

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