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한국균학회지 = The Korean journal of mycology v.26 no.2 = no.85, 1998년, pp.173 - 181   피인용횟수: 1

느타리 버섯류(Pleurotus spp.)의 생화학적 방법에 의한 품종구분
Identification of Varieties by Biochemical Methods in Pleurotus spp.

김동현   (고려대학교 자연자원대학원 식품공학과UU0000159  ); 공원식   (농업과학기술원 응용미생물과CC0131248  ); 김경수   (농업과학기술원 응용미생물과CC0131248  ); 김영호   (농업과학기술원 응용미생물과CC0131248  ); 유창현   (농업과학기술원 응용미생물과CC0131248  ); 김영배   (고려대학교 자연자원대학원 식품공학과UU0000159  );
  • 초록

    현재 우리나라에서 가장 많이 재배되고 있는 느타리버섯류 중 P. ostreatus, P. florida, P. sajorcaju의 3개 종 13개 품종에 대하여 rDNA분석 및 AP-PCR, RFLP를 실시하여 각 종 및 품종들에 대한 구분을 시도하였다. rDNA의 IGRI부위는 약0.9 kb로 증폭되었고, $ITSI{\sim}II$ 는 약 0.7 kb로 증폭되었다. 각 PCR 산물을 6가지 제한효소로 절단하여 polymorphism을 분석한 결과, $ITSI{\sim}II$ 부위를 HaeIII로 처리시 여름느타리에 특이적인 band를 보였다. 또한 유연관계를 분석하여 종간 차이를 구분할 수 있었다. AP-PCR를 실시한 결과 약 $2.0kb{\sim}150\;bp$ 의 다양한 band를 볼 수 있었고 P. florida종은 marker로 사용 가능한 특이 밴드가 발견되었다. 또한 사용된 primer에 따라 종간의 구별이 가능하였을 뿐 아니라 품종간에도 차이를 보이는 primer도 찾을 수 있었다. 품종을 구분하기 위한 RFLP 분석에서는 $ITSI{\sim}II$ 보다 IGRI probe가 더 큰 변이를 보였다.


    To identify genetic difference of 13 strains in three Pleurotus species, analyses of rDNA, AP-PCR and RFLP were carried out. IGRI and $ITSI{\sim}II$ regions of rDNA amplified by PCR were about 0.9 and 0.7 kb, respectively. These PCR products were digested with six restriction enzymes to analyse polymorphism. Especially, treatment of HaeIII enzyme on $ITSI{\sim}II$ regions showed specific bands in three Pleurotus sajor-caju strains. Genetic differences among three species were classified by similarity analyses based on rDNA polymorphism. Various band patterns of $2,500{\sim}150\;bp$ were showed by AP-PCR. Identification of species and varieties in 13 Pleurotus strains was possible according to primers used in AP-PCR. In order to develop genetic markers, RFLPs using IGRI and $ITSI{\sim}II$ probes derived from ASI 2180 and 2070 were carried out on eight Pleurotus varieties. RFLP patterns using IGRI probe were more various than that of $ITSI{\sim}II$ probe.


  • 주제어

    Pleurous spp.   .   r-DNA .   AP-PCR .   RFLP .   Identification of varieties.  

  • 참고문헌 (15)

    1. 팽나무 버섯(Flammulina velutipes) 수집균주의 유연관계와 새로운 균주 육성에 관한 연구 , 공원식 , / v.,pp.,
    2. 버섯 및 도열병균의 분류를 위한 rDNA의 ITS와 IGS부위의 PCR 분석 , 배신철 , / v.,pp.,
    3. The impact on mushroom production and mushroom products , Chang, S.T. , First International Conference on Mushroom Biology and Mushroom Products / v.,pp.1-35,
    4. Host speciesspecific conservation of a family of repeated sequence in the genomic of a fungal plant pathogen , Hamer, J.E.;Farrall, L.;Ortach, M.J.;Valent, B.;Chunmley, F.G. , Proc. Natl. Acad. Sci. / v.86,pp.9981-9985,
    5. Evolutionary relationships of Lentinus to the polyporaceae: Evidence from restriction analysis of enzymatically amplified ribosomal DNA , Hibbett, D.S.;Vilgalys, R. , Mycologia / v.83,pp.425-439,
    6. High-GC primers are useful in RAPD analysis of fungi , Kublik, A.R.;Szabo, L.J. , Curr. Genet. / v.28,pp.384-389,
    7. Selection of specific gene probes by combined use of low-stringency PCR amplification and southern-blot hybridization , Magdolen, U.;Magdolen, V.;Schmitt, M.;Bandlow, W. , Curr. Genet. / v.27,pp.390-392,
    8. Rapid identification of markers linked to a Pseudomonas resistance gene in tomato by using random primers and nearisogenic lines , Martin, G.B.;Williams, J.G.K.;Tanksley, S.D. , Prac. Natl. Acd. Sci. / v.88,pp.2336-2340,
    9. Molecular evolutionary genetics , Nei, M. , / v.,pp.106-107,
    10. Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System , Rohlf, F.J. , / v.,pp.,
    11. Allozymes, ribosomal DNA and breeding in Lentinula , Royse, D.J.;Nicholson, M.S. , Rept. Tottori Mycol. Inst. / v.31,pp.162-167,
    12. Polymorphisms generated by arbitraily primed PCR in the mouse: application to strain identification and genetic mapping , Welsh, J.;Peterson, C.;McClelland, A. , Nucleic Acids Research / v.19,pp.303-305,
    13. Amplification and direct sequencing of fungus ribosomal RNA genes for phylogenies. A guide to methods and applications , White, J.J.;Bruns, J.;Lee, S.;Taylor, J. , / v.,pp.315-322,
    14. DNA polymorphism amplified by arbitary primer are useful as genetic markers , Williams, J.G.K.;Kubelik, A.R.;Livak, K.J.;Rafalski, J.A.;Tingey, S.V. , Nucleic Acids Research / v.18,pp.6513-6535,
    15. Inheritance of DNA methylation in Coprinus cinerius , Zolan, M.E.;Pukkila, P.J. , Mol. Cell. Biol. / v.6,pp.195-200,
  • 이 논문을 인용한 문헌 (1)

    1. Choi, Jae-Sun ; Lee, Dong-Hee ; Chang, Hu-Bong ; Kang, Bo-Gu ; Koo, Chang-Duck 2009. "Genetic Relationship of Pleurotus ferulae Strains" 한국균학회지 = The Korean journal of mycology, 37(1): 28~32     

 저자의 다른 논문

  • 김동현 (3)

    1. 1997 "팽나무버섯(Flammulina velutipes) 단포자 분리주의 유전적 변이성" 한국균학회지 = The Korean journal of mycology 25 (2): 111~120    
    2. 1997 "개암버섯 균주의 유전적 특성과 최적 배지조건에 관한 시험" 한국균학회지 = The Korean journal of mycology 25 (2): 152~160    
    3. 1998 "목질진흙버섯(Phellinus linteus)의 균총형태 비교 및 PCR 기법을 이용한 동정" 한국균학회지 = The Korean journal of mycology 26 (4): 466~477    

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