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한국균학회지 = The Korean journal of mycology v.26 no.4 = no.87, 1998년, pp.466 - 477   피인용횟수: 1

목질진흙버섯(Phellinus linteus)의 균총형태 비교 및 PCR 기법을 이용한 동정
Identification of Phellinus linteus by Comparison of Colony Shapes and Using PCR techniques

공원식   (농업과학기술원 응용미생물과CC0131248  ); 김동현   (고려대학교 자연자원대학원UU0000159  ); 유창현   (농업과학기술원 응용미생물과CC0131248  ); 김영호   (농업과학기술원 응용미생물과CC0131248  ); 김경수   (농업과학기술원 응용미생물과CC0131248  ); 김광호   (건국대학교 농학과UU0000050  );
  • 초록

    진흙버섯류 22개 균주를 균총의 형태와 PCR 기법을 사용하여 종간의 구분 방법을 찾고자 하였다. PDA등 4가지 배지에서 균사생장 및 배지의 변색여부 등을 기준으로 특성을 구분할 때 목질진흙버섯의 균총 색깔은 진한 황색으로 균사생장이 늦고 배지를 푸르게 변색시켰다. rDNA 분석 결과 $ITSI{\sim}II$ 부위는 목질진흙버섯이 약 800 bp, 말똥진흙버섯은 약 700 bp였고, IGRI 부위는 목질진흙버섯은 약 700 bp, 말똥진흙버섯은 균주에 따라 약 500, 600, 700, 800 bp에서 4가지 각기 다른 밴드를 보였다. $ITSI{\sim}II$ 와 IGRI부위의 증폭된 DNA를 6개의 제한효소로 절단하여 다형성을 비교해 본 결과 $ITSI{\sim}II$ 의 HaeIII 절단으로 목질진흙버섯과 말똥진흙버섯을 구분할 수 있었으며 이들 밴드를 이용하여 유연관계를 조사한 결과 목질진흙버섯은 95%의 유사도를 보였으며, 말똥진흙버섯은 89%의 유사도로 complex를 형성하였다. 목질 진흙버섯은 RAPD 분석과 AP-PCR에 의한 밴드양상으로도 확실한 구분이 가능하였으며, $ITSI{\sim}II$ 부위의 HaeIII 제한효소 처리로 나타난 벤드는 이종의 특이적인 marker로 사용할 수 있을 것으로 본다.


    Twenty-two Phellinus strains were characterized using colony morphologies and polymerase chain reaction (PCR) to divide into Phellinus linteus. There were some differences in mycelial growth and colony shapes among the strains when they were grown on various media such as PDA, MCM, MEA and YM. Phellinus linteus was slowly growing, formed golden-yellow colony, and produced blue pigment on PDA media. When the regions of internal transcribed spacer (ITS) were amplified from ribosomal RNA (rRNA) coding genes of P. igniarius and P. linteus strains by means of PCR, two types of band (700 bp and 800 bp) were appeared, respectively. For the amplified intergenic region I (IGRI), P. igniarius strains showed a different band among 500, 600, 700 and 800 bp according to the strains, whereas P. linteus strains did one specific band of 700 bp. By polymorphism analysis after digesting the amplified products with 6 different restriction enzymes, a band specific to P. linteus was generated when the products for ITS region were digested with HaeIII, suggesting that the enzyme digestion could provide effective method to distinguish between P. igniarius and P. linteus. And also, the analysis of genetic relationship showed that the genetic similarities were 89% and 95% in P. igniarius and P. linteus strains, respectively. Random amplification polymorphic DNA (RAPD) analysis using multiple primer sets and arbitrarily primed PCR (AP-PCR) with ITS3 primer could also result in a reproducible way to identify P. linteus strains.


  • 주제어

    AP-PCR .   Phellinus linteus .   Phellinus igniarius .   RAPD .   rDNA.  

  • 참고문헌 (16)

    1. 잔나비걸상버섯(Elfuingia applanata) , 공원식 , 건국대 대학원논문집 / v.42,pp.351-361,
    2. 버섯 및 도열병균의 분류를 위한 rDNA의 ITS와 IGR부위의 PCR 분석 , 배신철 , / v.,pp.,
    3. 한국산 목재부후균류의 분포상에 대한 연구(II)-담자균류 민주름버섯목의 분포에 대하여 , 정학성 , 한국균학회지 / v.22,pp.62-99,
    4. Phellinus linteus 균사 배양물로부터 분리한 단백 다당체 Kp의 항암활성 , 정경수;김신숙;김희수;한만우;김병각 , 한국약학회지 / v.38,pp.158-165,
    5. きのこの化學.生化學 , 水野 卓;川合正允 , / v.,pp.35-45,
    6. North American Polypores. Megasporoporia-Wrightoporia , Gilbertson, R.L.;Ryvarden, L. , / v.,pp.885,
    7. Host speciesspecific conservation of a family of repeated sequence in the genomic of a fungal plant pathogen , Hamer, J.E.;Farrall, L.;Ortach, M.J.;Valent, E.;Chunmley, F.G. , Proc. Natl. Acad. Sci. / v.86,pp.9981-9985,
    8. Antitumor action of some basidiomycetes especially Phellinus linteus , Ikekawa, J.;Nakamishi, M.;Uehara, N.;Chihara, G.;Fukuoka, F. , Gann. / v.59,pp.155-157,
    9. Phellinus (Hymenochaetaceae): A survey of the world taxa. Synopsis Fungorum 3 , Larsen, M.J.;Cobb-Poulle, L.A. , / v.,pp.206,
    10. Selection of specific gene probes by combined use of low-stringency PCR amplification and southern-blot hybridization , Magdolen, U.;Magdolen, V.;Schmitt M.;Bandlow, W. , Curr. Genet. / v.27,pp.390-392,
    11. Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System , Rohlf, F.J. , / v.,pp.,
    12. Allozymes, ribosomal DNA and breeding in Lentinula , Royse, D.J.;Nicholson, M.S. , Rept. Tottori Mycol. Inst. / v.31,pp.162-167,
    13. Numerical Taxonomy , Sneath, P.H.A.;Sokal, R.R. , / v.,pp.573,
    14. Amplification and direct sequencing of fungus ribosomal RNA genes for phylogenics;A guide to methods and Applications , White, J.J.;Bruns, J.;Lee, S.;Taylor, J. , / v.,pp.,
    15. DNA polymorphism amplified by arbitrary primer are useful as genetic markers , Williams, J.G.K.;Kubelik, A.R.;Livak, K.J.;Rafalski, J.A.;Tingey, S.V. , Nucleic Acids Research / v.18,pp.6513-6535,
    16. Inheritance of DNA methylation in Coprinus cinerius , Zolan, M.E.;Pukkila, P.J. , Mol. Cell. BioI. / v.6,pp.195-200,
  • 이 논문을 인용한 문헌 (1)

    1. Choi, Jae-Sun ; Lee, Dong-Hee ; Chang, Hu-Bong ; Kang, Bo-Gu ; Koo, Chang-Duck 2009. "Genetic Relationship of Pleurotus ferulae Strains" 한국균학회지 = The Korean journal of mycology, 37(1): 28~32     

 저자의 다른 논문

  • 김동현 (3)

    1. 1997 "팽나무버섯(Flammulina velutipes) 단포자 분리주의 유전적 변이성" 한국균학회지 = The Korean journal of mycology 25 (2): 111~120    
    2. 1997 "개암버섯 균주의 유전적 특성과 최적 배지조건에 관한 시험" 한국균학회지 = The Korean journal of mycology 25 (2): 152~160    
    3. 1998 "느타리 버섯류(Pleurotus spp.)의 생화학적 방법에 의한 품종구분" 한국균학회지 = The Korean journal of mycology 26 (2): 173~181    
  • Kim, Kwang-Ho (42)

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