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Biotechnology and bioprocess engineering v.5 no.1, 2000년, pp.23 - 26   피인용횟수: 1

Identification of Genetic Markers for Korean Native Cattle (Hanwoo) by RAPD Analysis

Yeo Jung Sou    (Department of Animal Sciences, College of Natural Resources, Yeungnam University   ); Lee Ji Sun    (Division of Pharmacy, College of Pharmacy, Yeungnam University   ); Lee Chang Hee    (Division of Pharmacy, College of Pharmacy, Yeungnam University   ); Jung Young Ja    (Korea Food and Drug Administration   ); Nam Doo Hyun    (Division of Pharmacy, College of Pharmacy, Yeungnam University  );
  • 초록

    In order to develop the specific genetic marker for Korean native cattle (Hanwoo), randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis of 6 different cattle breeds was attempted by using 38 decamer primers. In comparison of RAPD patterns, two distinctive DNA bands specific for Hanwoo were detected. One was 296 bp of DNA fragment found to be specific only for female Hanwoo when primer GTCCACACGG was employed. In individual analysis of this RAPD marker was observed only in female individuals with the possibility of $85.3\%$ . The other was 521 bp of RAPD marker amplified using TCGGCGATAG and AGCCAGCGAA primers, which showed $83.0\%$ of genetic frequency in 85 male and 68 female individuals tested. Nucleotide sequencing of these genetic markers revealed that 296 bp marker has a short micro satellite-like sequence, ACCACCACAC, and a tandem repeat sequence of microsatellite GAAAAATG in the determined sequence. Two distinctive tandem repeats of microsatellite sequences, MC and GAAGA, were also appeared in 521 bp DNA marker. In BLAST search, any gene having high homology with these markers was not found.


  • 주제어

    RAPD marker .   Korean native cattle .   Hanwoo .   DNA polymorphism .   genetic analysis.  

  • 참고문헌 (16)

    1. Analysis of DNA polymorphism and genetic characteristics in Hol-stein dairy cattle using RAPD-PCR technique , Chunh, E. R.;W. T. Kim;S. K. Han , Korean J. Anim. Sci. / v.36,pp.263-270,
    2. Characterization of Zebu cattle breeds in Tanzania using radom amplified polymorphic DNA markers , Gwakisa, P. S.;S. J. Kemp;A. J. Teale , Anim. Genet. / v.25,pp.89-94,
    3. DNA fingerprinting in cattle using oligonucleotide probes , Buitkamp, J.;H. Zischler;J. T. Epplen;H. Geldermann , Anim. Genet. / v.22,pp.137-146,
    4. Use of RAPDs markers to estimate genetic variation in bovine populations , Bardin, M. G.;C. Bandi;S. Comincini;G. Damiani;G. Rognoni , Anim. Genet. / v.23,pp.57,
    5. Subfamilies of serine tRNA genes in the bovine genome , Chee, M. S.;H. Rizos;E. R. Henderson;R. Baker;T. S. Stewart , Mol. Gen. Genet. / v.231,pp.106-112,
    6. Development of RAPD marker specific for Korean cattle (Hanwoo) , Cho, B. W.;J. Y. Han , Korean J. Anim. Sci. / v.37,pp.263-270,
    7. Individual-specific 'fingerprints'of human DNA , Jeffreys, A. J.;V. Wilson;S. L. Thein , Nature / v.316,pp.76-79,
    8. Radomly primed PCR amplification of pooled DNA reveals polymorphism in a ruminant repetitive DNA sequence which differentiates Bos indicus and B. taurus , Kemp, S. J.;A. J. Teale , Anim. Genet. / v.25,pp.83-88,
    9. Hypervariable 'minisatellite' regions in human DNA , Jeffreys, A. J.;V. Wilson;S. L. Thein , Nature / v.314,pp.67-73,
    10. A bovine Y-specific marker amplified by RAPD , Antoniou, E.;C. J. Skidmore , Anim. Genet. / v.26,pp.444-445,
    11. DNA fingerprinting for individual indentification and parentage test in Japanese Black cattle using five different mini-and one microsatellite probes , Mannen, H.;S. Tsujii , J. Anim. Genet. / v.21,pp.62-68,
    12. Weising, K.;Nybom, H.;Wolff, K.;Meyer, W. , DNA Fingerprinting in Plants and Fungi / v.,pp.,
    13. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers , Williams, J. G. K.;A. R. Kubelik;K. J. Livak;J. A. Rafalski;S.V. Tingey , Nucleic Acid Res. / v.18,pp.6231-6235,
    14. Random amplified polymorphic patterns within Holstein cows and among various cattle breeds , Kwon, Y. M.;D. S. Yim;H. J. Lee;K. K. Cho;Y. J. Choi;M. G. Baik , Mol. Cells / v.5,pp.393-396,
    15. Random amplified polymorphic DNA in cattle and sheep: application for detecting genetic variation , Kantanen, J.;J. Vikki;K. Elo;A. Makitanila , Anim. Genet. / v.26,pp.315-320,
    16. Molecular Cloning , Sambrook, J.;E. F. Fritsch;T. Maniatis , A Laboratory Manual. 2nd Ed. / v.,pp.,
  • 이 논문을 인용한 문헌 (1)

    1. 2000. "" Biotechnology and bioprocess engineering, 5(2): 71~78     

 저자의 다른 논문

  • Yeo, Jung-Sou (34)

    1. 1982 "난용계의 초산일령이 산란능력과 란중에 미치는 영향" 가축번식학회지 6 (1): 36~38    
    2. 1988 "가금의 유전물질전달체로서의 원시생식세포의 이용" 가축번식학회지 12 (1): 11~14    
    3. 1988 "닭에서 2배수성 난자의 생성에 관한 연구" 家禽學會誌 = Korean journal of poultry science 15 (2): 67~71    
    4. 1989 "가축에서 세포유전학의 응용" 韓國受精卵移植學會誌 = Korean journal of embryo transfer 4 (1): 14~20    
    5. 1989 "한국 재래닭의 유전적 특성에 관한 조사 연구" 家禽學會誌 = Korean journal of poultry science 16 (4): 209~217    
    6. 1990 "닭에서 2배수성 배우자 생성에 의한 4배수성 생명체의 생산" 家禽學會誌 = Korean journal of poultry science 17 (1): 1~6    
    7. 1993 "한국 재래계의 유전자 지문에 관한 연구" 家禽學會誌 = Korean journal of poultry science 20 (4): 209~216    
    8. 1995 "DNA 지문을 이용한 가금의 유전분석과 개량" 한국가금학회지 = Korean journal of poultry science 22 (2): 97~104    
    9. 1995 "한국산 토종 닭고기의 품질 특성" 한국가금학회지 = Korean journal of poultry science 22 (4): 223~223    
    10. 1999 "DNA기술을 이용한 한우의 새로운 개량체계 확립" 종축개량 = Animal improvement 21 (3): 10~19    
  • 이지선 (9)

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