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Bulletin of the Korean Chemical Society v.25 no.11, 2004년, pp.1676 - 1680   피인용횟수: 1

Exploring Fine Structures of Photoactive Yellow Protein in Solution Using Wide-Angle X-ray Scattering

Kim, Tae-Kyu   (Department of Chemistry and School of Molecular Science (BK21), KAIST  ); Zuo, Xiaobing   (Chemistry Division, Argonne National Laboratory  ); Tiede, David M.    (Chemistry Division, Argonne National Laboratory   ); Ihee, Hyot-Cherl   (Department of Chemistry and School of Molecular Science (BK21), KAIST  );
  • 초록

    We demonstrate that wide-angle X-ray scattering pattern from photoactive yellow protein (PYP) in solution using a high flux third generation synchrotron X-ray source reflects not only the overall structure, but also fine structures of the protein. X-ray scattering data from PYP in solution have been collected in q ranges from 0.02 ${\AA}^{-1}$ to 2.8 ${\AA}^{-1}$ . These data are sensitive to the protein structure and consistent with the calculation based on known crystallographic atomic coordinates. Theoretical scattering patterns were also calculated for the intermediates during the photocycle of PYP to estimate the feasibility of time-resolved wide-angle X-ray scattering experiments on such proteins. These results demonstrate the possibility of using the wide-angle solution X-ray scattering as a quantitative monitor of photo-induced structural changes in PYP.


  • 주제어

    Wide-angle X-ray scattering .   Photoactive yellow protein .   Time-resolved .   Biological macromolecule .   3-Dimensional structure.  

  • 참고문헌 (35)

    1. Wulff, M.; Plech, A.; Eybert, L.; Randler, R.; Schotte, F.; Anfinrud, P. Faraday Discussions 2003, 122, 13. 
    2. Meyer, T. E. Biochem. Biophys. Acta 1985, 806, 175. 
    3. Baca, M.; Borgstahl, G. E. O.; Boissinot, M.; Burke, P. M.; Williams, D. R.; Slater, K. A.; Getzoff, E. D. Biochemistry 1994, 33, 14369. 
    4. Dux, P.; Rubinstenn, G.; Vuister, G. W.; Boelens, R.; Mulder, F. A.; Hard, K.; Hoff, W. D.; Kroon, A. R.; Crielaard, W.; Hellingwerf, K. J.; Kaptein, R. Biochemistry 1998, 37, 12689. 
    5. Kort, M.; Vonk, H.; Xu, X.; Hoff, W. D.; Crielaard, W.; Hellingwerf, K. J. FEBS Lett 1996, 382, 73. 
    6. Hoff, W. D.; Xie, A.; Van Stokkum, I. H. M.; Tang, X.; Gural, J.; Kroon, A. R.; Hellingwerf, K. J. Biochemistry 1999, 38, 1009. 
    7. Genick, U. K.; Soltis, S. M.; Kuhn, P.; Canestrelli, I. L.; Getzoff, E. D. Nature 1998, 392, 206. 
    8. Imamoto, Y.; Ito, T.; Kataoka, M.; Tokunaga, F. FEBS Lett. 1995, 374, 157. 
    9. Beno, M. A.; Jennings, G.; Engbretson, M.; Knapp, G. S.; Kurtz, C.; Zabransky, B.; Linton, J.; Seifert, S.; Wiley, C.; Montano, P. A. Nucl. Instrum. Meth. A 2001, 467, 690. 
    10. Ducruix, A.; Guilloteau, J. P.; Ries-Kautt, M.; Tardieu, A. J. Cryst. Growth 1996, 168, 28. 
    11. Schotte, F.; Lim, M. H.; Jackson, T. A.; Smirnov, A. V.; Soman, J.; Olson, J. S.; Phillips, G. N.; Wulff, M.; Anfinrud, P. A. Science 2003, 300, 1944. 
    12. Tiede, D. M.; Zhang, R.; Seifert, S. Biochemistry 2002, 41, 6605. 
    13. Sprenger, W. W.; Hoff, W. D.; Armitage, J. P.; Hellingwerf, K. J. J. Bacteriol. 1993, 175, 3096. 
    14. Imamoto, Y.; Mihara, K.; Tokunaga, F.; Kataoka, M. Biochemistry 2001, 40, 14336. 
    15. Imamoto, Y.; Kataoka, M.; Tokunaga, F.; Asahi, T.; Masuhara, H. Biochemistry 2001, 40, 6047. 
    16. Edwards, A. M.; Arrowsmith, C. H.; Christendat, D.; Dharamsi, A.; Friesen, J. D.; Greenblatt, J. F.; Vedadi, M. Nat. Struct. Biol. 2000, 7, 970. 
    17. Lim, M. Bull. Korean Chem. Soc. 2002, 23, 865.     
    18. Chacon, P.; Moran, F.; Diaz, J. F.; Pantos, E.; ANdreu, J. M. Biophys. J. 1998, 74, 2760. 
    19. Warren, B. E. X-ray Diffraction; Dover Publication, Inc.: New York, 1990. 
    20. Bratos, S.; Mirloup, F.; Vuilleumier, R.; Wulff, M. J. Chem. Phys. 2002, 116, 10615. 
    21. Zhang, R.; Marone, P. A.; Thiyagarajan, P.; Tiede, D. M. Langmuir 1999, 15, 7510. 
    22. Guinier, A. Fournet, G. Small-Angle Scattering of X-rays; John Wiley & Sons; New York, 1995. 
    23. Svergun, D. Biophys. J. 1999, 76, 2879. 
    24. Borgstahl, G. E. O.; Williams, D. R.; Getzoff, E. D. Biochemistry 1995, 34, 6278. 
    25. Tiede, D. M.; Zhang, R.; Chen, L. X.; Yu, L.; Lindsey, J. S. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 14054. 
    26. Zhang, R.; Thiyagarajan, P.; Tiede, D. M. J. Appl. Cryst. 2000, 33, 565. 
    27. Fraser, R. D. B.; MacRae, T. P.; Suzuki, E. J. Appl. Cryst. 1978, 11, 693. 
    28. Genick, U. K.; Borgstahl, G. E.; Ng, K.; Ren, Z.; Pradervand, C.; Burke, P. M.; Srajer, V.; Teng, T. Y.; Schildkamp, W.; McRee, D. E.; Moffat, K.; Getzoff, E. D. Science 1997, 275, 1471. 
    29. Kim, S.; Jin, G.; Lim, M. Bull. Korean Chem. Soc. 2003, 24, 1470.     
    30. Techert, S.; Schotte, F.; Wulff, M. Phys. Rev. Lett. 2001, 86, 2030. 
    31. Svergun, D.; Barberato, C.; Koch, M. H. J. J. Appl. Cryst. 1995, 28, 768. 
    32. Ujj, L.; Devanathan, S.; Meyer, T. E.; Cusanovich, M. A.; Tollin, G.; Atkinson, G. H. Biophys. J. 1998, 75, 406. 
    33. Fischetti, R. F.; Rodi, D. J.; Mirza, A.; Irving, T. C.; Kondrashkina, E.; Makowski, L. J. Synchrotron Rad. 2003, 10, 398. 
    34. Hirai, M.; Iwase, H.; Hayakawa, T.; Miura, K.; Inoue, K. J. Synchrotron Rad. 2002, 9, 202. 
    35. Hirai, M.; Iwase, H.; Hayakawa, T. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 10136. 
  • 이 논문을 인용한 문헌 (1)

    1. 2008. "" Bulletin of the Korean Chemical Society, 29(2): 450~462     

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