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Bulletin of the Korean Chemical Society v.25 no.12, 2004년, pp.1801 - 1806   피인용횟수: 1
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Ligand-based QSAR Studies on the Indolinones Derivatives as Inhibitors of the Protein Tyrosine Kinase of Fibroblast Growth Factor Receptor by CoMFA and CoMSIA

Hyun, Kwan-Hoon    (Department of Chemistry, Inha University   ); Kwack, In-Young    (Department of Chemistry, Inha University   ); Lee, Do-Young    (Department of Chemistry, Inha University   ); Park, Hyung-Yeon    (Department of Chemistry, Inha University   ); Lee, Bon-Su    (Department of Chemistry, Inha University   ); Kim, Chan-Kyung    (Department of Chemistry, Inha University  );
  • 초록

    Ligand-based quantitative structure-activity relationship (QSAR) studies were performed on indolinones derivatives as a potential inhibitor of the protein tyrosine kinase of fibroblast growth factor receptor (FGFR) by comparative molecular field analysis (CoMFA) and comparative molecular similarity indices analysis (CoMSIA) implemented in the SYBYL packages. The initial X-ray structure of docked ligand (Su5402) to FGFR was used to minimize the 27 training set molecules using TRIPOS force field. Seven models were generated using CoMFA and CoMSIA with grid spacing 2 ${\AA}$ . After the PLS analysis the best predicted CoMSIA model with hydrophobicity, hydrogen bond donor and acceptor property showed that a leave-one out(LOO) cross validated value $({r^2}_{cv})^$ and non-cross validated conventional value $({r^2}_{ncv})^$ are 0.543 and 0.938, respectively.


  • 주제어

    Ligand-based QSAR .   CoMFA .   CoMSIA .   Protein tyrosine kinase inhibitor .   Fibroblast growth factor receptor.  

  • 참고문헌 (20)

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  • 이 논문을 인용한 문헌 (1)

    1. 2008. "" Bulletin of the Korean Chemical Society, 29(2): 450~462     

 저자의 다른 논문

  • Hyun, Kwan-Hoon (2)

    1. 2004 "3D QSAR Studies on Cinnamaldehyde Analogues as Farnesyl Protein Transferase Inhibitors" Archives of pharmacal research : a publication of the Pharmaceutical Society of Korea 27 (10): 1001~1008    
    2. 2006 "3D-QSAR of Non-peptidyl Caspase-3 Enzyme Inhibitors Using CoMFA and CoMSIA" Bulletin of the Korean Chemical Society 27 (2): 273~276    
  • Kwack, In-Young (0)

  • 이도영 (2)

  • 박형연 (9)

  • Lee, Bon-Su (40)

  • Kim, Chang-Kyung (29)

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