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FEMS microbiology letters v.108 no.1, 1993년, pp.117 - 120  

A PCR primer-specific to Cylindrocarpon heteronema for detection of the pathogen in apple wood

Brown, A.E. (Department of Applied Plant Science, The Queen's University of Belfast, ,, Belfast, UK ); Muthumeenakshi, S. ( ); Sreenivasaprasad, S. ( ); Mills, P.R. ( ); Swinburne, T.R. ( );
  • 초록  

    An oligonucleotide primer (ChInt) was synthesised from the variable internally transcribed spacer (ITS) 1 region of ribosomal DNA (rDNA) of Cylindrocarpon heteronema. PCR with primers ChInt and ITS4 (from a conserved sequence of the rDNA) amplified a 470-bp fragment from several isolates of C. heteronema but not from various apple wood saprophytes. Amplification of this fragment was achieved from 1-2 pg of fungal DNA. These primers amplified a fragment of the same size from DNA extracted from cankered wood but only after impurities were removed from the DNA on a Qiagen tip-5 column. Southern hybridization analysis confirmed the 470-bp fragment from C. heteronema DNA and cankered wood to be identical.


  • 주제어

    Cylindrocarpon heteronema .   Diagnostic polymerase chain reaction .   Oligonucleotide primer .   DNA purification.  

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