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The Korean journal of laboratory medicine v.30 no.3 = no.121, 2010년, pp.325 - 328   SCIE
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Discrepancy in Genotyping of Apolipoprotein E between Allele-Specific PCR and Fluorescence Resonance Energy Transfer or Sequencing.

Park, Chang Hun   Lee, Seung Tae   Ki, Chang Seok   Kim, Jong Won  
  • 초록

    The human apolipoprotein E (APOE) gene contains several single-nucleotide polymorphisms (SNPs) that are distributed across the gene. The genotype of the APOE gene has important implications as a risk factor for various diseases. We observed 2 cases in which the results of allele-specific PCR (AS-PCR) of the APOE gene were not consistent with those of fluorescence resonance energy transfer (FRET) or sequencing analysis. In these cases, genotyping by AS-PCR showed that patients were epsilon2 homozygotes, while sequencing analysis and FRET showed that they were epsilon2/epsilon3 heterozygotes. Herein, we describe the causes of the errors in genotyping and describe the significance of these errors.


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