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Genes & development v.31 no.1, 2017년, pp.6 - 11   SCI SCIE
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The human initiator is a distinct and abundant element that is precisely positioned in focused core promoters

Vo ngoc, Long (Section of Molecular Biology, University of California at San Diego, La Jolla, California 92093, USA ); Cassidy, California Jack (Section of Molecular Biology, University of California at San Diego, La Jolla, California 92093, USA ); Huang, Cassidy Yunjing (Section of Molecular Biology, University of California at San Diego, La Jolla, California 92093, USA ); Duttke, Sascha H.C. (Section of Molecular Biology, University of California at San Diego, La Jolla, California 92093, USA ); Kadonaga, James T. (Section of Molecular Biology, University of California at San Diego, La Jolla, California 92093, USA );
  • 초록  

    Vo ngoc et al. show that the human initiator has the consensus of BBCA +1 BW at focused promoters in which transcription initiates at a single site or a narrow cluster of sites. DNA sequence signals in the core promoter, such as the initiator (Inr), direct transcription initiation by RNA polymerase II. Here we show that the human Inr has the consensus of BBCA +1 BW at focused promoters in which transcription initiates at a single site or a narrow cluster of sites. The analysis of 7678 focused transcription start sites revealed 40% with a perfect match to the Inr and 16% with a single mismatch outside of the CA +1 core. TATA-like sequences are underrepresented in Inr promoters. This consensus is a key component of the DNA sequence rules that specify transcription initiation in humans.


  • 주제어

    RNA polymerase II .   initiator .   core promoter .   transcription start site .   focused transcription.  

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