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Cell systems v.4 no.1, 2017년, pp.121 - 128.e4  

Systems Genetics Approach Identifies Gene Pathways and Adamts2 as Drivers of Isoproterenol-Induced Cardiac Hypertrophy and Cardiomyopathy in Mice

Rau, C.D. ; Romay, M.C. ; Tuteryan, M. ; Wang, J.J.C. ; Santolini, M. ; Ren, S. ; Karma, A. ; Weiss, J.N. ; Wang, Y. ; Lusis, A.J. ;
  • 초록  

    We previously reported a genetic analysis of heart failure traits in a population of inbred mouse strains treated with isoproterenol to mimic catecholamine-driven cardiac hypertrophy. Here, we apply a co-expression network algorithm, wMICA, to perform a systems-level analysis of left ventricular transcriptomes from these mice. We describe the features of the overall network but focus on a module identified in treated hearts that is strongly related to cardiac hypertrophy and pathological remodeling. Using the causal modeling algorithm NEO, we identified the gene Adamts2 as a putative regulator of this module and validated the predictive value of NEO using small interfering RNA-mediated knockdown in neonatal rat ventricular myocytes. Adamts2 silencing regulated the expression of the genes residing within the module and impaired isoproterenol-induced cellular hypertrophy. Our results provide a view of higher order interactions in heart failure with potential for diagnostic and therapeutic insights.


  • 주제어

    causal modeling .   siRNA mediated knockdown .   MICA .   ventricular myocytes .   gene network.  

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