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Molecular cell v.65 no.4, 2017년, pp.685 - 698.e8   SCI SCIE
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Paf1 Has Distinct Roles in Transcription Elongation and Differential Transcript Fate

Fischl, Harry (Department of Biochemistry, University of Oxford, South Parks Road, Oxford OX1 3QU, UK ) ; Howe, Françoise S. (Department of Biochemistry, University of Oxford, South Parks Road, Oxford OX1 3QU, UK ) ; Furger, Andre (Department of Biochemistry, University of Oxford, South Parks Road, Oxford OX1 3QU, UK ) ; Mellor, Jane (Department of Biochemistry, University of Oxford, South Parks Road, Oxford OX1 3QU, UK ) ;
  • 초록  

    Summary RNA polymerase II (Pol2) movement through chromatin and the co-transcriptional processing and fate of nascent transcripts is coordinated by transcription elongation factors (TEFs) such as polymerase-associated factor 1 (Paf1), but it is not known whether TEFs have gene-specific functions. Using strand-specific nucleotide resolution techniques, we show that levels of Paf1 on Pol2 vary between genes, are controlled dynamically by environmental factors via promoters, and reflect levels of processing and export factors on the encoded transcript. High levels of Paf1 on Pol2 promote transcript nuclear export, whereas low levels reflect nuclear retention. Strains lacking Paf1 show marked elongation defects, although low levels of Paf1 on Pol2 are sufficient for transcription elongation. Our findings support distinct Paf1 functions: a core general function in transcription elongation, satisfied by the lowest Paf1 levels, and a regulatory function in determining differential transcript fate by varying the level of Paf1 on Pol2. Highlights Strand-specific maps of Paf1 on Pol2 using TEF-seq Paf1 influences transcription elongation at all genes Paf1 is dynamically enriched/depleted on Pol2, independent of its role in elongation Paf1 enrichment promotes nuclear export of the encoded transcripts Graphical Abstract [DISPLAY OMISSION]


  • 주제어

    Paf1 .   differential mRNP nuclear export .   transcription elongation .   TEF-seq .   NET-seq .   lncRNA .   mRNA .   RNA polymerase II .   nucleosome .   Saccharomyces cerevisiae.  

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