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Journal of molecular biology v.429 no.22, 2017년, pp.3388 - 3394   SCI SCIE
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Advancing our Understanding of Ubiquitination Using the Ub-Toolkit

Witting, Katharina F. (Corresponding author. ); Mulder, Monique P.C. ( ); Ovaa, Huib ( );
  • 초록  

    Abstract Post-translational protein modification by ubiquitin (Ub) and Ub-like modifiers is orchestrated by the sequential action of Ub-activating, -conjugating, and -ligating enzymes to regulate a vast array of fundamental biological processes. Unsurprisingly, the dysregulation of the intricate interplay between ubiquitination and deubiquitination gives rise to numerous pathologies, most notably cancer and neurodegenerative diseases. While activity-based probes (ABPs) and assay reagents have been extensively developed and applied for deubiquitinating enzymes, similar tools for the Ub cascade have only recently emerged. Given the recent efforts to develop inhibitors for the Ub system, the urgency for developing ABPs and assay reagents is imminent. In this light, we comprehensively discuss the currently available ABPs with a focus on the newly developed reagents targeting the Ub cascade while illustrating their potential applications. Highlights Ubiquitination regulates nearly all cellular events, and deregulation contributes to disease. ABPs target the active site of enzymes allowing their identification, isolation, and characterization. Several ABPs specific for the Ub cascade have recently been reported. Novel tools for assaying E1, E2, and E3 enzyme activity are required for inhibitor development. Graphical Abstract [DISPLAY OMISSION]


  • 주제어

    activity-based probes .   activity-based profiling .   ubiquitin E1 .   E2 and E3 enzymes .   ligases.  

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