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Computers in biology and medicine v.95, 2018년, pp.99 - 106   SCI SCIE SCOPUS
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eTRIKS platform: Conception and operation of a highly scalable cloud-based platform for translational research and applications development

Bussery, Justin (Corresponding author. ) ; Denis, Leslie-Alexandre ; Guillon, Benjamin ; Liu, Pengfeï ; Marchetti, Gino ; Rahal, Ghita ;
  • 초록  

    Abstract We describe the genesis, design and evolution of a computing platform designed and built to improve the success rate of biomedical translational research. The eTRIKS project platform was developed with the aim of building a platform that can securely host heterogeneous types of data and provide an optimal environment to run tranSMART analytical applications. Many types of data can now be hosted, including multi-OMICS data, preclinical laboratory data and clinical information, including longitudinal data sets. During the last two years, the platform has matured into a robust translational research knowledge management system that is able to host other data mining applications and support the development of new analytical tools. Highlights The article describes Cloud-based platform developed for eTRIKS project to answer translational research analysis needs. Platform structure is built to host and provide computational tools to diverse translational research projects. eTRIKS has made available to the community more than a hundred curated public biomedical studies through a single portal. The platform makes available on a single portal applications needed to perform translational analysis on available data. The platform is made sustainable and upgradeable to new studies and new applications.


  • 주제어

    Computing .   Cloud .   eTRIKS .   tranSMART .   Hosting .   Analysis .   Security .   Translational research .   Authentication .   Platform .   Storage .   Web application .   Knowledge management.  

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