본문 바로가기
HOME> 논문 > 논문 검색상세

논문 상세정보

Journal of medical virology v.90 no.9, 2018년, pp.1486 - 1492  

Performance comparison of deep sequencing platforms for detecting HIV‐1 variants in the pol gene

Nicot, Florence (Laboratoire de Virologie, CHU de Toulouse, Hôpital Purpan, Toulouse, France ) ; Jeanne, Nicolas (Laboratoire de Virologie, CHU de Toulouse, Hôpital Purpan, Toulouse, France ) ; Raymond, Stéphanie (Laboratoire de Virologie, CHU de Toulouse, Hôpital Purpan, Toulouse, France ) ; Delfour, Olivier (Laboratoire de Virologie, CHU de Toulouse, Hôpital Purpan, Toulouse, France ) ; Carcenac, Romain (Laboratoire de Virologie, CHU de Toulouse, Hôpital Purpan, Toulouse, France ) ; Lefebvre, Caroline (Laboratoire de Virologie, CHU de Toulouse, Hôpital Purpan, Toulouse, France ) ; Sauné, Karine (Laboratoire de Virologie, CHU de Toulouse, Hôpital Purpan, Toulouse, France ) ; Delobel, Pierre (INSERM, U1043, Toulouse, France ) ; Izopet, Jacques (Laboratoire de Virologie, CHU de Toulouse, Hôpital Purpan, Toulouse, ) ;
  • 초록  

    The present study compares the performances of an in‐house sequencing protocol developed on MiSeq, the Sanger method, and the 454 GS‐FLX for detecting and quantifying drug‐resistant mutations (DRMs) in the human immunodeficiency virus polymerase gene (reverse transcriptase [RT] and protease [PR]). MiSeq sequencing identified all the resistance mutations detected by bulk sequencing (n = 84). Both the MiSeq and 454 GS‐FLX platforms identified 67 DRMs in the RT and PR regions, but a further 25 DRMs were identified by only one or other of them. Pearson’s analysis showed good concordance between the percentage of drug‐resistant variants determined by MiSeq and 454 GS‐FLX sequencing ( ρ = .77 .77, P


  • 주제어

    deep sequencing .   MiSeq .   polymerase drug resistance.  

 활용도 분석

  • 상세보기

    amChart 영역
  • 원문보기

    amChart 영역

원문보기

무료다운로드
  • 원문이 없습니다.
유료다운로드

유료 다운로드의 경우 해당 사이트의 정책에 따라 신규 회원가입, 로그인, 유료 구매 등이 필요할 수 있습니다. 해당 사이트에서 발생하는 귀하의 모든 정보활동은 NDSL의 서비스 정책과 무관합니다.

원문복사신청을 하시면, 일부 해외 인쇄학술지의 경우 외국학술지지원센터(FRIC)에서
무료 원문복사 서비스를 제공합니다.

NDSL에서는 해당 원문을 복사서비스하고 있습니다. 위의 원문복사신청 또는 장바구니 담기를 통하여 원문복사서비스 이용이 가능합니다.

이 논문과 함께 출판된 논문 + 더보기