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Mitochondrial dna. Part b. Resources v.3 no.2, 2018년, pp.755 - 757   SCIE SCOPUS
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The complete chloroplast genome sequence of Solanum hougasii, one of the potato wild relative species

Cho, Kwang-Soo Cho, Ji-Hong Im, Ju-Sung Choi, Jang-Gyu Park, Young-Eun Jang, Dong-Chil Hong, Su-Young Park, Tae-Ho
  • 초록  

    Solanum hougasii is a wild tuber-bearing species belonging to the family Solanaceae. The complete chloroplast genome of S. hougasii was constituted by de novo assembly, using a small amount of whole genome sequencing data. The chloroplast genome of S. hougasii was a circular DNA molecule with a length of 155,549 bp and consisted of 85,990 bp of large single copy, 18,373 bp of small single copy, and 25,593 bp of a pair of inverted repeat regions. A total of 158 genes were annotated, including 105 protein-coding genes, 45 tRNA genes, and eight rRNA genes. Maximum likelihood phylogenetic analysis with 25 Solanaceae species revealed that S. hougasii is most closely grouped with S. tuberosum.


  • 주제어

    Chloroplast .   genome .   genome sequence .   Solanum hougasii.  

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