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Proceedings of the National Academy of Sciences of... 110건

  1. [해외논문]   Back Matter  


    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America v.96 no.12 , 1999 , 0027-8424 ,

    초록

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  2. [해외논문]   Front Matter  


    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America v.96 no.12 , 1999 , 0027-8424 ,

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  3. [해외논문]   Models of treatment effects when responses are heterogeneous  

    Moffitt, RA
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America v.96 no.12 ,pp. 6575 - 6576 , 1999 , 0027-8424 ,

    초록

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  4. [해외논문]   Self-assembly of chlorophenols in water  

    Rogalska, E , Rogalski, M , Gulik-Krzywicki, T , Gulik, A , Chipot, C
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America v.96 no.12 ,pp. 6577 - 6580 , 1999 , 0027-8424 ,

    초록

    In saturated solutions of some di- and trichlorophenols, structures with complex morphologies, consisting of thin, transparent sheets often coiling into helices and ultimately twisting into filaments, were observed under the optical microscope. Freeze-fracture electron microscopy, x-ray diffraction, phase diagrams, and molecular modeling were performed to elucidate the observed phenomena. Here, we present evidence that the chlorophenols studied, when interacting with water, self-assemble into bilayers. The fact that some chlorophenols form the same supramolecular structures as those described previously for structurally nonrelated surfactants sheds light on the mechanisms of self-assembly.

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  5. [해외논문]   Catalysis of peptide dissociation from class II MHC-peptide complexes.  

    Schmitt, L , Kratz, J R , Davis, M M , McConnell, H M
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America v.96 no.12 ,pp. 6581 - 6586 , 1999 , 0027-8424 ,

    초록

    Certain peptides such as dynorphin A [dynA-(1-13)] enhance the release of antigenic peptides bound to class II MHC molecules at neutral pH. This enhanced release has been termed push off. Previous work has shown that the antigenic pigeon cytochrome c peptide PCC-(89-104) has at least two conformational isomers when bound to the class II MHC protein I-Ek. We have accordingly studied the push off of PCC-(89-104) from the complex PCC-(89-104)/I-Ek to see whether these isomeric conformations are distinguished by the push-off effect. A comparison of the association and dissociation kinetics of PCC-(89-104)/I-Ek in the presence of dynA-(1-13) shows that dynA-(1-13) does not simply replace PCC-(89-104) but rather acts catalytically. The major product is peptide-free I-Ek, which is receptive to further peptide binding. Evidence is presented that a two peptide-one MHC complex is formed in solution. This ternary complex represents the first step of the mechanism of push off. 19F NMR data are presented that indicate that dynA-(1-13) interacts specifically with only one of the two isomeric complexes of PCC-(89-104) and I-Ek. A push-off mechanism is proposed in which dynA-(1-13) binds outside the peptide binding groove. In a second step, the dissociation of one of the two isomers is specifically enhanced. Thus the push-off effect may be useful for identifying conformational isomers and for separating them.

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  6. [해외논문]   Cytochrome b562 folding triggered by electron transfer: approaching the speed limit for formation of a four-helix-bundle protein.  

    Wittung-Stafshede, P , Lee, J C , Winkler, J R , Gray, H B
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America v.96 no.12 ,pp. 6587 - 6590 , 1999 , 0027-8424 ,

    초록

    Ferrocytochrome b562 [Fe(II)cyt b562] folding can be triggered by photoinduced electron transfer to unfolded Fe(III)cyt b562 in 2-3 M guanidine hydrochloride solutions. The folding rates increase with decreasing guanidine hydrochloride; the extrapolated time constant for this folding process in the absence of denaturant (5 micros) is near the predicted value for intrachain diffusion. The relatively smooth energy landscape indicated for Fe(II)cyt b562 folding accords with the helical, highly symmetrical structure of the protein.

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  7. [해외논문]   Accurate quantitation of protein expression and site-specific phosphorylation.  

    Oda, Y , Huang, K , Cross, F R , Cowburn, D , Chait, B T
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America v.96 no.12 ,pp. 6591 - 6596 , 1999 , 0027-8424 ,

    초록

    A mass spectrometry-based method is described for simultaneous identification and quantitation of individual proteins and for determining changes in the levels of modifications at specific sites on individual proteins. Accurate quantitation is achieved through the use of whole-cell stable isotope labeling. This approach was applied to the detection of abundance differences of proteins present in wild-type versus mutant cell populations and to the identification of in vivo phosphorylation sites in the PAK-related yeast Ste20 protein kinase that depend specifically on the G1 cyclin Cln2. The present method is general and affords a quantitative description of cellular differences at the level of protein expression and modification, thus providing information that is critical to the understanding of complex biological phenomena.

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  8. [해외논문]   The force exerted by a molecular motor.  

    Fisher, M E , Kolomeisky, A B
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America v.96 no.12 ,pp. 6597 - 6602 , 1999 , 0027-8424 ,

    초록

    The stochastic driving force exerted by a single molecular motor (e. g., a kinesin, or myosin) moving on a periodic molecular track (microtubule, actin filament, etc.) is discussed from a general viewpoint open to experimental test. An elementary "barometric" relation for the driving force is introduced that (i) applies to a range of kinetic and stochastic models, (ii) is consistent with more elaborate expressions entailing explicit representations of externally applied loads, and (iii) sufficiently close to thermal equlibrium, satisfies an Einstein-type relation in terms of the velocity and diffusion coefficient of the (load-free) motor. Even in the simplest two-state models, the velocity-vs.-load plots exhibit a variety of contrasting shapes (including nonmonotonic behavior). Previously suggested bounds on the driving force are shown to be inapplicable in general by analyzing discrete jump models with waiting time distributions.

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  9. [해외논문]   Vibro-acoustography: an imaging modality based on ultrasound-stimulated acoustic emission.  

    Fatemi, M , Greenleaf, J F
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America v.96 no.12 ,pp. 6603 - 6608 , 1999 , 0027-8424 ,

    초록

    We describe theoretical principles of an imaging modality that uses the acoustic response of an object to a highly localized dynamic radiation force of an ultrasound field. In this method, named ultrasound-stimulated vibro-acoustography (USVA), ultrasound is used to exert a low-frequency (in kHz range) force on the object. In response, a portion of the object vibrates sinusoidally in a pattern determined by its viscoelastic properties. The acoustic emission field resulting from object vibration is detected and used to form an image that represents both the ultrasonic and low-frequency (kHz range) mechanical characteristics of the object. We report the relation between the emitted acoustic field and the incident ultrasonic pressure field in terms of object parameters. Also, we present the point-spread function of the imaging system. The experimental images in this report have a resolution of about 700 microm, high contrast, and high signal-to-noise ratio. USVA is sensitive enough to detect object motions on the order of nanometers. Possible applications include medical imaging and material evaluation.

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  10. [해외논문]   A small nucleolar RNA:ribozyme hybrid cleaves a nucleolar RNA target in vivo with near-perfect efficiency.  

    Samarsky, D A , Ferbeyre, G , Bertrand, E , Singer, R H , Cedergren, R , Fournier, M J
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America v.96 no.12 ,pp. 6609 - 6614 , 1999 , 0027-8424 ,

    초록

    A hammerhead ribozyme has been localized to the yeast nucleolus by using the U3 small nucleolar RNA as a carrier. The hybrid small nucleolar RNA:ribozyme, designated a "snorbozyme," is metabolically stable and cleaves a target U3 RNA with nearly 100% efficiency in vivo. This is the most efficient in vivo cleavage reported for a trans-acting ribozyme. A key advantage of the model substrate featured is that a stable, trimmed cleavage product accumulates. This property allows accurate kinetic measurements of authentic cleavage in vivo. The system offers new avenues for developing effective ribozymes for research and therapeutic applications.

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