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Genome announcements 21건

  1. [해외논문]   Draft Genome Sequence of an Erythromycin-Resistant Propionibacterium acnes Isolate Recovered from Folliculitis of the Scalp  

    Aubin, Guillaume Ghislain (Bacteriology and Hygiene department, Nantes University Hospital, Nantes, France ) , Kambarev, Stanimir (Institut de Recherche en Santéééééé) , Guillouzouic, Auré (de l'Universitééééééé) , lie (de Nantes INSERM U892-CNRS 6299 CRCNA Centre de Recherche en Cancéééééééérologie Nantes Angers Universitééééééééé) , Khammari, Amir (de Nantes, Team 13: Nuclear Oncology Research, Nantes, France ) , Dré (Bacteriology and Hygiene department, Nantes University Hospital, Nantes, France ) , é (Institut de Recherche en Santéééééééééé) , no, Brigitte (de l'Universitééééééééééé) , Corvec, Sté (de Nantes INSERM U892-CNRS 6299 CRCNA Centre de Recherche en Cancéééééééééééérologie Nantes A) , é , é , phane
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01490-16 - e01490-16 , 2017 ,

    초록

    Propionibacterium acnes is now well-known and recognized for its implication in the pathogenesis of acne vulgaris. Here, we report the draft genome sequence of an erythromycin-resistant P. acnes strain isolated from a case of folliculitis of the scalp belonging to phylotype IA1 and sequence type 18 (ST18).

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    Fig. 1 이미지
  2. [해외논문]   Complete Genome Sequence of Lactococcus piscium CNCM I-4031, a Bioprotective Strain for Seafood Products  

    Marché (UMR1014 SECALIM, INRA, Oniris, Nantes, France ) , , Laurent (UMR1014 SECALIM, INRA, Oniris, Nantes, France ) , Saraoui, Taous (UMR1014 SECALIM, INRA, Oniris, Nantes, France ) , Remenant, Benoit (UMR1014 SECALIM, INRA, Oniris, Nantes, France ) , Zagorec, Monique (UMR1014 SECALIM, INRA, Oniris, Nantes, France ) , Pré (Ifremer, Laboratoire Ecosystéééèmes Microbiens et Moléééèécules Marines pour les Biotechnologies (EM<sup>3</sup>B), Nantes, France ) , é (Ifremer, Laboratoire Ecosystéééèmes Microbiens et Moléééèécules Marines pour les Biotechnologies (EM<sup>3</sup>B), Nantes, France ) , é (UMR1014 SECALIM, INRA, Oniris, Nantes, France) , vost, Hervé , é , , Delbarre-Ladrat, Christine , Leroi, Francoise , Pilet, Marie France
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01510-16 - e01510-16 , 2017 ,

    초록

    Lactococcus piscium CNCM I-4031 is a psychotrophic foodborne lactic acid bacterium showing potential interest for the biopreservation of seafood products due to its inhibition properties toward pathogenic and spoilage bacteria. The analysis of its genome will provide a better understanding of the mechanisms of interaction between these bacteria.

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  3. [해외논문]   Draft Genome Sequence of the Plant Growth-Promoting Rhizobacterium Pseudomonas fluorescens Strain CREA-C16 Isolated from Pea (Pisum sativum L.) Rhizosphere  

    D'Agostino, Nunzio (CREA-ORT, Consiglio per la Ricerca in Agricoltura e l'Analisi dell'Economia Agraria, Centro di Ricerca per l'Orticoltura, Pontecagnano Faiano, Salerno, Italy ) , Sorrentino, Roberto (CREA-ORT, Consiglio per la Ricerca in Agricoltura e l'Analisi dell'Economia Agraria, Centro di Ricerca per l'Orticoltura, Pontecagnano Faiano, Salerno, Italy ) , Scotti, Riccardo (CREA-ORT, Consiglio per la Ricerca in Agricoltura e l'Analisi dell'Economia Agraria, Centro di Ricerca per l'Orticoltura, Pontecagnano Faiano, Salerno, Italy ) , Salzano, Melania (CREA-ORT, Consiglio per la Ricerca in Agricoltura e l'Analisi dell'Economia Agraria, Centro di Ricerca per l'Orticoltura, Pontecagnano Faiano, Salerno, Italy ) , Aurilia, Vincenzo (National Research Council of Italy, Institute for Mediterranean Agriculture and Forest Systems, Ercolano, Naples, Italy ) , Zaccardelli, Massimo (CREA-ORT, Consiglio per la Ricerca in Agricoltura e l'Analisi dell'Economia Agraria, Centro di Ricerca per l'Orticoltura, Pontecagnano Faiano, Salerno, Italy)
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01456-16 - e01456-16 , 2017 ,

    초록

    Herein, we report the draft genome sequence of Pseudomonas fluorescens strain CREA-C16, a plant growth-promoting rhizobacterium that was isolated from the rhizosphere of Pisum sativum L. plants. The genome sequence is ~6 Mb in size, with a G+C content of 60.1%, and includes 4,457 candidate protein-encoding genes.

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  4. [해외논문]   Beatrice Hill Virus Represents a Novel Species in the Genus Tibrovirus (Mononegavirales: Rhabdoviridae)  

    Wiley, Michael R. (U.S. Army Medical Research Institute of Infectious Diseases, Fort Detrick, Frederick, Maryland, USA ) , Prieto, Karla (U.S. Army Medical Research Institute of Infectious Diseases, Fort Detrick, Frederick, Maryland, USA ) , Blasdell, Kim R. (Commonwealth Scientific and Industrial Research Organization (CSIRO), Health and Biosecurity, Australian Animal Health Laboratory, Geelong, Victoria, Australia ) , Caí (Integrated Research Facility at Fort Detrick, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, National Institutes of Health, Fort Detrick, Frederick, Maryland, USA ) , ú (Integrated Research Facility at Fort Detrick, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, National Institutes of Health, Fort Detrick, Frederick, Maryland, USA ) , ì (Commonwealth Scientific and Industrial Research Organization (CSIRO), Health and Biosecurity, Australian Animal Health Laboratory, Geelong, Victoria, Australia ) , , Yí (University of California, San Francisco, California, USA ) , ngyí (U.S. Army Medical Research Institute of Infectious Diseases, Fort D) , ú , n , Campos Lawson, Cristine , Walker, Peter J. , Chiu, Charles Y. , Palacios, Gustavo , Kuhn, Jens H.
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01485-16 - e01485-16 , 2017 ,

    초록

    The rhabdoviral genus Tibrovirus currently has three official members assigned to two species: Bivens Arm virus and Tibrogargan virus (species Tibrogargan tibrovirus ) and Coastal Plains virus (species Coastal Plains tibrovirus ). Here, we report the complete genome sequence of a new putative member of this genus, Beatrice Hill virus. Although relatively closely related to the three classified viruses, Beatrice Hill virus represents a novel Tibrovirus species.

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  5. [해외논문]   Draft Genome Sequence of Weissella confusa MBF8-1, a Glucansucrase- and Bacteriocin-Producing Strain Isolated from a Homemade Soy Product  

    Heng, Nicholas C. K. (Sir John Walsh Research Institute, Faculty of Dentistry, University of Otago, Dunedin, New Zealand ) , Yeh, Chia-Wen (Sir John Walsh Research Institute, Faculty of Dentistry, University of Otago, Dunedin, New Zealand ) , Malik, Amarila (Division of Pharmaceutical Microbiology and Biotechnology, Faculty of Pharmacy, Universitas Indonesia, Depok, Indonesia)
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01497-16 - e01497-16 , 2017 ,

    초록

    We report here the draft genome sequence of Weissella confusa MBF8-1, an isolate from a homemade fermented soybean product that produces sucrases and exhibits antibacterial (bacteriocin) activity. The draft genome of W. confusa MBF8-1 comprises a 2.2-Mbp chromosome and a 17.8-kbp bacteriocin-encoding plasmid. Two putative glucansucrase genes were also identified.

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  6. [해외논문]   Complete Genome Sequence of Streptococcus iniae 89353, a Virulent Strain Isolated from Diseased Tilapia in Taiwan  

    Gong, Hong-Yi (Department of Aquaculture, National Taiwan Ocean University, Keelung, Taiwan ) , Wu, Sheng-Han (Department of Aquaculture, National Taiwan Ocean University, Keelung, Taiwan ) , Chen, Chun-Yao (Department of Life Science, Tzu Chi University, Hualien, Taiwan ) , Huang, Chang-Wen (Department of Aquaculture, National Taiwan Ocean University, Keelung, Taiwan ) , Lu, Jenn-Kan (Department of Aquaculture, National Taiwan Ocean University, Keelung, Taiwan ) , Chou, Hsin-Yiu (Department of Aquaculture, National Taiwan Ocean University, Keelung, Taiwan)
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01524-16 - e01524-16 , 2017 ,

    초록

    Streptococcus iniae 89353 is a virulent strain isolated from diseased tilapia in Taiwan. The full-genome sequence of S. iniae 89353 is 2,098,647 bp. The revealed genome information will be beneficial for identification and understanding of potential virulence genes of Streptococcus iniae and possible immunogens for vaccine development against streptococcosis.

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  7. [해외논문]   Draft Genome Sequence of Plant Growth–Promoting Micrococcus luteus Strain K39 Isolated from Cyperus conglomeratus in Saudi Arabia  

    Lafi, Feras F. (King Abdullah University of Science and Technology (KAUST), Biological and Environmental Sciences and Engineering Division (BESE), Thuwal, Kingdom of Saudi Arabia ) , Ramirez-Prado, Juan S. (King Abdullah University of Science and Technology (KAUST), Biological and Environmental Sciences and Engineering Division (BESE), Thuwal, Kingdom of Saudi Arabia ) , Alam, Intikhab (Computational Bioscience Research Center (CBRC), King Abdullah University of Science and Technology (KAUST), Thuwal, Kingdom of Saudi Arabia ) , Bajic, Vladimir B. (Computational Bioscience Research Center (CBRC), King Abdullah University of Science and Technology (KAUST), Thuwal, Kingdom of Saudi Arabia ) , Hirt, Heribert (King Abdullah University of Science and Technology (KAUST), Biological and Environmental Sciences and Engineering Division (BESE), Thuwal, Kingdom of Saudi Arabia ) , Saad, Maged M. (King Abdullah University of Science and Technology (KAUST), Biological and Environmental Sciences and Engineering Division (BESE), Thuwal, Kingdom of Saudi Arabia)
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01520-16 - e01520-16 , 2017 ,

    초록

    Micrococcus luteus strain K39 is an endophyte bacterium isolated from roots of the desert plant Cyperus conglomeratus collected from the Red Sea shore, Thuwal, Saudi Arabia. The draft genome sequence of strain K39 revealed a number of enzymes involved in salinity and oxidative stress tolerance or having herbicide-resistance activity.

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  8. [해외논문]   Draft Genome Sequence of Nocardioides luteus Strain BAFB, an Alkane-Degrading Bacterium Isolated from JP-7-Polluted Soil  

    Brown, Lisa M. (University of Dayton Research Institute, Dayton, Ohio, USA ) , Gunasekera, Thusitha S. (University of Dayton Research Institute, Dayton, Ohio, USA ) , Ruiz, Oscar N. (Fuels and Energy Branch, Aerospace Systems Directorate, Air Force Research Laboratory, Wright-Patterson AFB, Ohio, USA)
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01529-16 - e01529-16 , 2017 ,

    초록

    Nocardioides luteus strain BAFB is a Gram-positive bacterium that efficiently degrades C 8 to C 11 alkanes aerobically. The draft genome of N. luteus BAFB is 5.76 Mb in size, with 5,358 coding sequences and 69.9% G+C content. The genes responsible for alkane degradation are present in this strain.

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  9. [해외논문]   Complete Genome Sequence of Acinetobacter sp. Strain NCu2D-2 Isolated from a Mouse  

    Blaschke, Ulrike (Robert Koch Institute, Wernigerode Branch, Wernigerode, Germany ) , Wilharm, Gottfried (Robert Koch Institute, Wernigerode Branch, Wernigerode, Germany)
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01415-16 - e01415-16 , 2017 ,

    초록

    Whole-genome sequencing of Acinetobacter sp. strain NCu2D-2, isolated from the trachea of a mouse, revealed the presence of a plasmid of 309,964 bp with little overall similarity to known plasmids and enriched in insertion sequences (ISs) closely related to IS elements known from the nosocomial pathogen Acinetobacter baumannii .

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  10. [해외논문]   Genome Sequence of Herpes Simplex Virus 1 Strain SC16  

    Rastrojo, Alberto (Department of Virology and Microbiology, Centro de Biologóñííía Molecular Severo Ochoa (Consejo Superior de Investigaciones Cientóñííííficas and Universidad Autóñííííónoma de Madrid), Cantoblanco, Madrid, Spain ) , Ló (Department of Virology and Microbiology, Centro de Biologóñííía Molecular Severo Ochoa (Consejo Superior de Investigaciones Cientóñííííficas and Universidad Autóñííííónoma de Madrid), Cantoblanco, Madrid, Spain ) , pez-Muó (Department of Virology and Microbiology, Centro de Biologóñííía Molecular Severo Ochoa (Consejo Superior de Investigaciones Cientóñííííficas and Universidad Autóñííííónoma de Madrid), Cantoblanco,) , ñ , oz, Alberto Domingo , Alcamó , ñ , í , , Antonio
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01392-16 - e01392-16 , 2017 ,

    초록

    Herpes simplex virus 1 (HSV-1), also known as Human herpesvirus 1 , is a highly prevalent human neurotropic pathogen that causes a variety of diseases, including lethal encephalitis. Here, we report the genome sequence of the HSV-1 strain SC16.

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