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Genome announcements 21건

  1. [해외논문]   Complete and Assembled Genome Sequence of Vagococcus teuberi DSM 21459 T , a Novel Species Isolated from Fermented Cow Milk in Mali  

    Stevens, Marc J. A. (Laboratory of Food Biotechnology, Institute of Food, Nutrition and Health, ETH Zurich, Zurich, Switzerland ) , Inglin, Raffael C. (Laboratory of Food Biotechnology, Institute of Food, Nutrition and Health, ETH Zurich, Zurich, Switzerland ) , Meile, Leo (Laboratory of Food Biotechnology, Institute of Food, Nutrition and Health, ETH Zurich, Zurich, Switzerland)
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01514-16 , 2017 ,

    초록

    ABSTRACT The genome of Vagococcus teuberi DSM 21459 T , a strain isolated from Malian fermented milk, was sequenced using single-molecule real-time sequencing. The genome of V. teuberi DSM 21459 T is the first sequenced genome of this novel species and the second genome among the genus Vagococcus .

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  2. [해외논문]   Complete Genome Sequence of Acinetobacter sp. Strain NCu2D-2 Isolated from a Mouse  

    Blaschke, Ulrike (Robert Koch Institute, Wernigerode Branch, Wernigerode, Germany ) , Wilharm, Gottfried (Robert Koch Institute, Wernigerode Branch, Wernigerode, Germany)
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01415-16 , 2017 ,

    초록

    ABSTRACT Whole-genome sequencing of Acinetobacter sp. strain NCu2D-2, isolated from the trachea of a mouse, revealed the presence of a plasmid of 309,964 bp with little overall similarity to known plasmids and enriched in insertion sequences (ISs) closely related to IS elements known from the nosocomial pathogen Acinetobacter baumannii .

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  3. [해외논문]   Draft Genome Sequence of Sorghum Grain Mold Fungus Epicoccum sorghinum , a Producer of Tenuazonic Acid  

    Oliveira, Rodrigo C. (Department of Microbiology, University of São Paulo, São Paulo, Brazil ) , Davenport, Karen W. (Biosciences Division, Los Alamos National Laboratory, Los Alamos, New Mexico, USA ) , Hovde, Blake (Biosciences Division, Los Alamos National Laboratory, Los Alamos, New Mexico, USA ) , Silva, Danielle (Department of Microbiology, University of São Paulo, São Paulo, Brazil ) , Chain, Patrick S. G. (Biosciences Division, Los Alamos National Laboratory, Los Alamos, New Mexico, USA ) , Correa, Benedito (Department of Microbiology, University of São Paulo, São Paulo, Brazil ) , Rodrigues, Debora F. (Civil and Environmental Engineering, University of Houston, Houston, Texas, USA)
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01495-16 , 2017 ,

    초록

    ABSTRACT The facultative plant pathogen Epicoccum sorghinum is associated with grain mold of sorghum and produces the mycotoxin tenuazonic acid. This fungus can have serious economic impact on sorghum production. Here, we report the draft genome sequence of E. sorghinum (USPMTOX48).

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  4. [해외논문]   Draft Genome Sequence of an Erythromycin-Resistant Propionibacterium acnes Isolate Recovered from Folliculitis of the Scalp  

    Aubin, Guillaume Ghislain (Bacteriology and Hygiene department, Nantes University Hospital, Nantes, France ) , Kambarev, Stanimir (Institut de Recherche en Santé) , Guillouzouic, Auré (de l'Université) , lie (de Nantes INSERM U892-CNRS 6299 CRCNA Centre de Recherche en Cancérologie Nantes Angers Université) , Khammari, Amir (de Nantes, Team 13: Nuclear Oncology Research, Nantes, France ) , Dré (Bacteriology and Hygiene department, Nantes University Hospital, Nantes, France ) , no, Brigitte (Institut de Recherche en Santé) , Corvec, Sté (de l'Université) , phane (de Nantes INSERM U892-CNRS 6299 CRCNA Centre de Recherche en Cancérologie Nantes Angers Université)
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01490-16 , 2017 ,

    초록

    ABSTRACT Propionibacterium acnes is now well-known and recognized for its implication in the pathogenesis of acne vulgaris. Here, we report the draft genome sequence of an erythromycin-resistant P. acnes strain isolated from a case of folliculitis of the scalp belonging to phylotype IA1 and sequence type 18 (ST18).

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  5. [해외논문]   Draft Genome Sequence of Plant Growth–Promoting Micrococcus luteus Strain K39 Isolated from Cyperus conglomeratus in Saudi Arabia  

    Lafi, Feras F. (King Abdullah University of Science and Technology (KAUST), Biological and Environmental Sciences and Engineering Division (BESE), Thuwal, Kingdom of Saudi Arabia ) , Ramirez-Prado, Juan S. (King Abdullah University of Science and Technology (KAUST), Biological and Environmental Sciences and Engineering Division (BESE), Thuwal, Kingdom of Saudi Arabia ) , Alam, Intikhab (Computational Bioscience Research Center (CBRC), King Abdullah University of Science and Technology (KAUST), Thuwal, Kingdom of Saudi Arabia ) , Bajic, Vladimir B. (Computational Bioscience Research Center (CBRC), King Abdullah University of Science and Technology (KAUST), Thuwal, Kingdom of Saudi Arabia ) , Hirt, Heribert (King Abdullah University of Science and Technology (KAUST), Biological and Environmental Sciences and Engineering Division (BESE), Thuwal, Kingdom of Saudi Arabia ) , Saad, Maged M. (King Abdullah University of Science and Technology (KAUST), Biological and Environmental Sciences and Engineering Division (BESE), Thuwal, Kingdom of Saudi Arabia)
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01520-16 , 2017 ,

    초록

    ABSTRACT Micrococcus luteus strain K39 is an endophyte bacterium isolated from roots of the desert plant Cyperus conglomeratus collected from the Red Sea shore, Thuwal, Saudi Arabia. The draft genome sequence of strain K39 revealed a number of enzymes involved in salinity and oxidative stress tolerance or having herbicide-resistance activity.

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  6. [해외논문]   Complete Genome Sequence of Lactococcus piscium CNCM I-4031, a Bioprotective Strain for Seafood Products  

    Marché (UMR1014 SECALIM, INRA, Oniris, Nantes, France ) , , Laurent (UMR1014 SECALIM, INRA, Oniris, Nantes, France ) , Saraoui, Taous (UMR1014 SECALIM, INRA, Oniris, Nantes, France ) , Remenant, Benoit (UMR1014 SECALIM, INRA, Oniris, Nantes, France ) , Zagorec, Monique (UMR1014 SECALIM, INRA, Oniris, Nantes, France ) , Pré (Ifremer, Laboratoire Ecosystèmes Microbiens et Molécules Marines pour les Biotechnologies (EM<sup>3</sup>B), Nantes, France ) , vost, Hervé (Ifremer, Laboratoire Ecosystèmes Microbiens et Molécules Marines pour les Biotechnologies (EM<sup>3</sup>B), Nantes, France ) , (UMR1014 SECALIM, INRA, Oniris, Nantes, France) , Delbarre-Ladrat, Christine , Leroi, Franç , oise , Pilet, Marie France
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01510-16 , 2017 ,

    초록

    ABSTRACT Lactococcus piscium CNCM I-4031 is a psychotrophic foodborne lactic acid bacterium showing potential interest for the biopreservation of seafood products due to its inhibition properties toward pathogenic and spoilage bacteria. The analysis of its genome will provide a better understanding of the mechanisms of interaction between these bacteria.

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  7. [해외논문]   Beatrice Hill Virus Represents a Novel Species in the Genus Tibrovirus ( Mononegavirales : Rhabdoviridae )  

    Wiley, Michael R. (U.S. Army Medical Research Institute of Infectious Diseases, Fort Detrick, Frederick, Maryland, USA ) , Prieto, Karla (U.S. Army Medical Research Institute of Infectious Diseases, Fort Detrick, Frederick, Maryland, USA ) , Blasdell, Kim R. (Commonwealth Scientific and Industrial Research Organization (CSIRO), Health and Biosecurity, Australian Animal Health Laboratory, Geelong, Victoria, Australia ) , Caì (Integrated Research Facility at Fort Detrick, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, National Institutes of Health, Fort Detrick, Frederick, Maryland, USA ) , , Yí (Integrated Research Facility at Fort Detrick, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, National Institutes of Health, Fort Detrick, Frederick, Maryland, USA ) , ngyú (Commonwealth Scientific and Industrial Research Organization (CSIRO), Health and Biosecurity, Australian Animal Health Laboratory, Geelong, Victoria, Australia ) , n (University of California, San Francisco, California, USA ) , Campos Lawson, Cristine (U.S. Army Medical Research Institute of Infectious Diseases, Fort D) , Walker, Peter J. , Chiu, Charles Y. , Palacios, Gustavo , Kuhn, Jens H.
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01485-16 , 2017 ,

    초록

    ABSTRACT The rhabdoviral genus Tibrovirus currently has three official members assigned to two species: Bivens Arm virus and Tibrogargan virus (species Tibrogargan tibrovirus ) and Coastal Plains virus (species Coastal Plains tibrovirus ). Here, we report the complete genome sequence of a new putative member of this genus, Beatrice Hill virus. Although relatively closely related to the three classified viruses, Beatrice Hill virus represents a novel Tibrovirus species.

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  8. [해외논문]   Draft Genome Sequences of Semiconstitutive Red, Dry, and Rough Biofilm-Forming Commensal and Uropathogenic Escherichia coli Isolates  

    Cimdins, Annika (Department of Microbiology, Tumor and Cell Biology, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden ) , Lü (Department of Microbiology, Tumor and Cell Biology, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden ) , thje, Petra (Department of Microbiology, Tumor and Cell Biology, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden ) , Li, Fengyang (Department of Microbiology, Tumor and Cell Biology, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden ) , Ahmad, Irfan (Department of Microbiology, Tumor and Cell Biology, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden ) , Brauner, Annelie (Department of Microbiology, Tumor and Cell Biology, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden) , Rö , mling, Ute
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01249-16 , 2017 ,

    초록

    ABSTRACT Strains of Escherichia coli exhibit diverse biofilm formation capabilities. E. coli K-12 expresses the red, dry, and rough (rdar) morphotype below 30°C, whereas clinical isolates frequently display the rdar morphotype semiconstitutively. We sequenced the genomes of eight E. coli strains to subsequently investigate the molecular basis of semiconstitutive rdar morphotype expression.

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  9. [해외논문]   Complete Genome Sequence of Streptococcus iniae 89353, a Virulent Strain Isolated from Diseased Tilapia in Taiwan  

    Gong, Hong-Yi (Department of Aquaculture, National Taiwan Ocean University, Keelung, Taiwan ) , Wu, Sheng-Han (Department of Aquaculture, National Taiwan Ocean University, Keelung, Taiwan ) , Chen, Chun-Yao (Department of Life Science, Tzu Chi University, Hualien, Taiwan ) , Huang, Chang-Wen (Department of Aquaculture, National Taiwan Ocean University, Keelung, Taiwan ) , Lu, Jenn-Kan (Department of Aquaculture, National Taiwan Ocean University, Keelung, Taiwan ) , Chou, Hsin-Yiu (Department of Aquaculture, National Taiwan Ocean University, Keelung, Taiwan)
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01524-16 , 2017 ,

    초록

    ABSTRACT Streptococcus iniae 89353 is a virulent strain isolated from diseased tilapia in Taiwan. The full-genome sequence of S. iniae 89353 is 2,098,647 bp. The revealed genome information will be beneficial for identification and understanding of potential virulence genes of Streptococcus iniae and possible immunogens for vaccine development against streptococcosis.

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  10. [해외논문]   Draft Genome Sequence of Coniochaeta ligniaria NRRL 30616, a Lignocellulolytic Fungus for Bioabatement of Inhibitors in Plant Biomass Hydrolysates  

    Jimé (Cluster of Microbial Ecology, Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences, University of Groningen, Groningen, The Netherlands ) , nez, Diego Javier (Bioenergy Research Unit, National Center for Agricultural Utilization Research, USDA-ARS, Peoria, Illinois, USA ) , Hector, Ronald E. (U.S. Department of Energy Joint Genome Institute, Walnut Creek, California, USA ) , Riley, Robert (U.S. Department of Energy Joint Genome Institute, Walnut Creek, California, USA ) , Lipzen, Anna (U.S. Department of Energy Joint Genome Institute, Walnut Creek, California, USA ) , Kuo, Rita C. (U.S. Department of Energy Joint Genome Institute, Walnut Creek, California, USA ) , Amirebrahimi, Mojgan (U.S. Department of Energy Joint Genome Institute, Walnut Creek, California, USA ) , Barry, Kerrie W. (U.S. Department of Energy Joint Genome Institute, Walnut Creek, California, USA ) , Grigoriev, Igor V. (Cluster of Microbial Ecology, Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences, University of Groningen, Groningen, The Netherlands ) , van Elsas, Jan Dirk (Bioenergy Research Unit, National Center for Agricultural Utilization Research, USDA-ARS, Peoria, Illinois, USA) , Nichols, Nancy N.
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01476-16 , 2017 ,

    초록

    ABSTRACT Here, we report the first draft genome sequence (42.38 Mb containing 13,657 genes) of Coniochaeta ligniaria NRRL 30616, an ascomycete with biotechnological relevance in the bioenergy field given its high potential for bioabatement of toxic furanic compounds in plant biomass hydrolysates and its capacity to degrade lignocellulosic material.

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