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Genome announcements 21건

  1. [해외논문]   Complete Genome Sequence of the Dairy Isolate Lactobacillus acidipiscis ACA-DC 1533  

    Kazou, Maria (Laboratory of Dairy Research, Department of Food Science and Human Nutrition, Agricultural University of Athens, Athens, Greece ) , Alexandraki, Voula (Laboratory of Dairy Research, Department of Food Science and Human Nutrition, Agricultural University of Athens, Athens, Greece ) , Pot, Bruno (Research Group of Industrial Microbiology and Food Biotechnology (IMDO), Vrije Universiteit Brussel, Brussels, Belgium ) , Tsakalidou, Effie (Laboratory of Dairy Research, Department of Food Science and Human Nutrition, Agricultural University of Athens, Athens, Greece ) , Papadimitriou, Konstantinos (Laboratory of Dairy Research, Department of Food Science and Human Nutrition, Agricultural University of Athens, Athens, Greece)
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01533-16 - e01533-16 , 2017 ,

    초록

    Lactobacillus acidipiscis is a Gram-positive lactic acid bacterium belonging to the Lactobacillus salivarius clade. Here, we present the first complete genome sequence of L. acidipiscis isolated from traditional Greek Kopanisti cheese. Strain ACA-DC 1533 may play a key role in the strong organoleptic characteristics of Kopanisti cheese.

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  2. [해외논문]   Draft Genome Sequence of an Erythromycin-Resistant Propionibacterium acnes Isolate Recovered from Folliculitis of the Scalp  

    Aubin, Guillaume Ghislain (Bacteriology and Hygiene department, Nantes University Hospital, Nantes, France ) , Kambarev, Stanimir (Institut de Recherche en Santéééééé) , Guillouzouic, Auré (de l'Universitééééééé) , lie (de Nantes INSERM U892-CNRS 6299 CRCNA Centre de Recherche en Cancéééééééérologie Nantes Angers Universitééééééééé) , Khammari, Amir (de Nantes, Team 13: Nuclear Oncology Research, Nantes, France ) , Dré (Bacteriology and Hygiene department, Nantes University Hospital, Nantes, France ) , é (Institut de Recherche en Santéééééééééé) , no, Brigitte (de l'Universitééééééééééé) , Corvec, Sté (de Nantes INSERM U892-CNRS 6299 CRCNA Centre de Recherche en Cancéééééééééééérologie Nantes A) , é , é , phane
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01490-16 - e01490-16 , 2017 ,

    초록

    Propionibacterium acnes is now well-known and recognized for its implication in the pathogenesis of acne vulgaris. Here, we report the draft genome sequence of an erythromycin-resistant P. acnes strain isolated from a case of folliculitis of the scalp belonging to phylotype IA1 and sequence type 18 (ST18).

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  3. [해외논문]   Beatrice Hill Virus Represents a Novel Species in the Genus Tibrovirus (Mononegavirales: Rhabdoviridae)  

    Wiley, Michael R. (U.S. Army Medical Research Institute of Infectious Diseases, Fort Detrick, Frederick, Maryland, USA ) , Prieto, Karla (U.S. Army Medical Research Institute of Infectious Diseases, Fort Detrick, Frederick, Maryland, USA ) , Blasdell, Kim R. (Commonwealth Scientific and Industrial Research Organization (CSIRO), Health and Biosecurity, Australian Animal Health Laboratory, Geelong, Victoria, Australia ) , Caí (Integrated Research Facility at Fort Detrick, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, National Institutes of Health, Fort Detrick, Frederick, Maryland, USA ) , ú (Integrated Research Facility at Fort Detrick, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, National Institutes of Health, Fort Detrick, Frederick, Maryland, USA ) , ì (Commonwealth Scientific and Industrial Research Organization (CSIRO), Health and Biosecurity, Australian Animal Health Laboratory, Geelong, Victoria, Australia ) , , Yí (University of California, San Francisco, California, USA ) , ngyí (U.S. Army Medical Research Institute of Infectious Diseases, Fort D) , ú , n , Campos Lawson, Cristine , Walker, Peter J. , Chiu, Charles Y. , Palacios, Gustavo , Kuhn, Jens H.
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01485-16 - e01485-16 , 2017 ,

    초록

    The rhabdoviral genus Tibrovirus currently has three official members assigned to two species: Bivens Arm virus and Tibrogargan virus (species Tibrogargan tibrovirus ) and Coastal Plains virus (species Coastal Plains tibrovirus ). Here, we report the complete genome sequence of a new putative member of this genus, Beatrice Hill virus. Although relatively closely related to the three classified viruses, Beatrice Hill virus represents a novel Tibrovirus species.

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  4. [해외논문]   Complete Genome Sequence of Acinetobacter sp. Strain NCu2D-2 Isolated from a Mouse  

    Blaschke, Ulrike (Robert Koch Institute, Wernigerode Branch, Wernigerode, Germany ) , Wilharm, Gottfried (Robert Koch Institute, Wernigerode Branch, Wernigerode, Germany)
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01415-16 - e01415-16 , 2017 ,

    초록

    Whole-genome sequencing of Acinetobacter sp. strain NCu2D-2, isolated from the trachea of a mouse, revealed the presence of a plasmid of 309,964 bp with little overall similarity to known plasmids and enriched in insertion sequences (ISs) closely related to IS elements known from the nosocomial pathogen Acinetobacter baumannii .

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  5. [해외논문]   Draft Genome Sequence of the Plant Growth-Promoting Rhizobacterium Pseudomonas fluorescens Strain CREA-C16 Isolated from Pea (Pisum sativum L.) Rhizosphere  

    D'Agostino, Nunzio (CREA-ORT, Consiglio per la Ricerca in Agricoltura e l'Analisi dell'Economia Agraria, Centro di Ricerca per l'Orticoltura, Pontecagnano Faiano, Salerno, Italy ) , Sorrentino, Roberto (CREA-ORT, Consiglio per la Ricerca in Agricoltura e l'Analisi dell'Economia Agraria, Centro di Ricerca per l'Orticoltura, Pontecagnano Faiano, Salerno, Italy ) , Scotti, Riccardo (CREA-ORT, Consiglio per la Ricerca in Agricoltura e l'Analisi dell'Economia Agraria, Centro di Ricerca per l'Orticoltura, Pontecagnano Faiano, Salerno, Italy ) , Salzano, Melania (CREA-ORT, Consiglio per la Ricerca in Agricoltura e l'Analisi dell'Economia Agraria, Centro di Ricerca per l'Orticoltura, Pontecagnano Faiano, Salerno, Italy ) , Aurilia, Vincenzo (National Research Council of Italy, Institute for Mediterranean Agriculture and Forest Systems, Ercolano, Naples, Italy ) , Zaccardelli, Massimo (CREA-ORT, Consiglio per la Ricerca in Agricoltura e l'Analisi dell'Economia Agraria, Centro di Ricerca per l'Orticoltura, Pontecagnano Faiano, Salerno, Italy)
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01456-16 - e01456-16 , 2017 ,

    초록

    Herein, we report the draft genome sequence of Pseudomonas fluorescens strain CREA-C16, a plant growth-promoting rhizobacterium that was isolated from the rhizosphere of Pisum sativum L. plants. The genome sequence is ~6 Mb in size, with a G+C content of 60.1%, and includes 4,457 candidate protein-encoding genes.

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  6. [해외논문]   Draft Genome Sequences of Semiconstitutive Red, Dry, and Rough Biofilm-Forming Commensal and Uropathogenic Escherichia coli Isolates  

    Cimdins, Annika (Department of Microbiology, Tumor and Cell Biology, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden ) , Luthje, Petra (Department of Microbiology, Tumor and Cell Biology, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden ) , Li, Fengyang (Department of Microbiology, Tumor and Cell Biology, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden ) , Ahmad, Irfan (Department of Microbiology, Tumor and Cell Biology, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden ) , Brauner, Annelie (Department of Microbiology, Tumor and Cell Biology, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden ) , Romling, Ute (Department of Microbiology, Tumor and Cell Biology, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden)
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01249-16 - e01249-16 , 2017 ,

    초록

    Strains of Escherichia coli exhibit diverse biofilm formation capabilities. E. coli K-12 expresses the red, dry, and rough (rdar) morphotype below 30°C, whereas clinical isolates frequently display the rdar morphotype semiconstitutively. We sequenced the genomes of eight E. coli strains to subsequently investigate the molecular basis of semiconstitutive rdar morphotype expression.

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  7. [해외논문]   Draft Genome Sequence of Staphylococcus succinus subsp. succinus Type Strain DSM 14617, Isolated from Plant and Soil Inclusions within 25- to 35-Million-Year-Old Dominican Amber  

    Zhou, Hairui (Department of Medical School, Jiamusi University, Jiamusi, PR China ) , Yao, Zhenyu (Department of Medical School, Jiamusi University, Jiamusi, PR China ) , Shi, Haihong (Department of Medical School, Jiamusi University, Jiamusi, PR China ) , Wang, Baixin (Department of Medical School, Jiamusi University, Jiamusi, PR China ) , Li, Dong (Department of Medical School, Jiamusi University, Jiamusi, PR China ) , Hou, Jie (Department of Medical School, Jiamusi University, Jiamusi, PR China ) , Ma, Shuxia (Department of Medical School, Jiamusi University, Jiamusi, PR China)
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01521-16 - e01521-16 , 2017 ,

    초록

    Staphylococcus succinus  subsp.  succinus type strain DSM 14617 was isolated from plant and soil inclusions within 25- to 35-million-year-old Dominican amber. The complete genome sequence of strain DSM 14617 T includes a genome of 2.88 Mb (32.94% G+C content) without any plasmids.

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  8. [해외논문]   Complete and Assembled Genome Sequence of Vagococcus teuberi DSM 21459T, a Novel Species Isolated from Fermented Cow Milk in Mali  

    Stevens, Marc J. A. (Laboratory of Food Biotechnology, Institute of Food, Nutrition and Health, ETH Zurich, Zurich, Switzerland ) , Inglin, Raffael C. (Laboratory of Food Biotechnology, Institute of Food, Nutrition and Health, ETH Zurich, Zurich, Switzerland ) , Meile, Leo (Laboratory of Food Biotechnology, Institute of Food, Nutrition and Health, ETH Zurich, Zurich, Switzerland)
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01514-16 - e01514-16 , 2017 ,

    초록

    The genome of Vagococcus teuberi DSM 21459 T , a strain isolated from Malian fermented milk, was sequenced using single-molecule real-time sequencing. The genome of V. teuberi DSM 21459 T is the first sequenced genome of this novel species and the second genome among the genus Vagococcus .

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  9. [해외논문]   Genome Sequence of the Symbiotic Type Strain Rhizobium tibeticum CCBAU85039T  

    Torres Tejerizo, Gonzalo (CeBiTec, Bielefeld University, Genome Research of Industrial Microorganisms, Bielefeld, Germany ) , Wibberg, Daniel (CeBiTec, Bielefeld University, Genome Research of Industrial Microorganisms, Bielefeld, Germany ) , Winkler, Anika (CeBiTec, Bielefeld University, Genome Research of Industrial Microorganisms, Bielefeld, Germany ) , Ormeñ (Laboratorio de Ecologñíííóía Microbiana y Biotecnologñíííóíía, Departamento de Biologñíííóííía, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional Agraria La Molina, Lima, Peru ) , o-Orrillo, Ernesto (Centro de Ciencias Genñíííóíííómicas, Universidad Nacional Autñíííóíííóónoma de Mñíííóíííóóéxico, Cuernavaca, Morelos, Mexico ) , Martñ (CeBiTec, Bielefeld University, Genome Research of) , í , nez-Romero, Esperanza , Niehaus, Karsten , Puhler, Alfred , Kalinowski, Jorn , Lagares, Antonio , Schluter, Andreas , Pistorio, Mariano
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01513-16 - e01513-16 , 2017 ,

    초록

    Rhizobium tibeticum was originally isolated from root nodules of Trigonella archiducis-nicolai grown in Tibet, China. This species is also able to nodulate Medicago sativa and Phaseolus vulgaris . The whole-genome sequence of the type strain, R. tibeticum CCBAU85039 T , is reported in this study.

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  10. [해외논문]   Complete Genome Sequence of Lactococcus piscium CNCM I-4031, a Bioprotective Strain for Seafood Products  

    Marché (UMR1014 SECALIM, INRA, Oniris, Nantes, France ) , , Laurent (UMR1014 SECALIM, INRA, Oniris, Nantes, France ) , Saraoui, Taous (UMR1014 SECALIM, INRA, Oniris, Nantes, France ) , Remenant, Benoit (UMR1014 SECALIM, INRA, Oniris, Nantes, France ) , Zagorec, Monique (UMR1014 SECALIM, INRA, Oniris, Nantes, France ) , Pré (Ifremer, Laboratoire Ecosystéééèmes Microbiens et Moléééèécules Marines pour les Biotechnologies (EM<sup>3</sup>B), Nantes, France ) , é (Ifremer, Laboratoire Ecosystéééèmes Microbiens et Moléééèécules Marines pour les Biotechnologies (EM<sup>3</sup>B), Nantes, France ) , é (UMR1014 SECALIM, INRA, Oniris, Nantes, France) , vost, Hervé , é , , Delbarre-Ladrat, Christine , Leroi, Francoise , Pilet, Marie France
    Genome announcements v.5 no.4 ,pp. e01510-16 - e01510-16 , 2017 ,

    초록

    Lactococcus piscium CNCM I-4031 is a psychotrophic foodborne lactic acid bacterium showing potential interest for the biopreservation of seafood products due to its inhibition properties toward pathogenic and spoilage bacteria. The analysis of its genome will provide a better understanding of the mechanisms of interaction between these bacteria.

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