본문 바로가기
HOME> 보고서 > 보고서 검색상세

보고서 상세정보

Chemical genomics를 이용한 유전체 기능연구
Functional Studies of Genome Using Chemical Genomics

  • 사업명

    21C 프론티어연구개발사업

  • 과제명

    Chemical Genomics를 이용한 유전체 기능연구.

  • 주관연구기관

    한국과학기술연구원
    Korea Institute Of Science and Technology

  • 연구책임자

    유재훈

  • 참여연구자

    유연규   신계정   강순방   이종국   권미윤   이경현   신병희   김지영   강하탄   최윤희   김윤경   ...  

  • 보고서유형

    1단계보고서

  • 발행국가

    대한민국

  • 언어

    한국어

  • 발행년월

    2000-07

  • 과제시작년도

    2002

  • 주관부처

    과학기술부

  • 사업 관리 기관

    한국과학재단
    Korea Science and Engineering Foundtion

  • 등록번호

    TRKO201000012245

  • 과제고유번호

    1350006855

  • 키워드

    화학유전체학.파지-디스플레이 라이브러리.바이오패닝.항암제.암세포 표적.chemical genomics.phage displayed library.biopanning.anti-cancer agent.new target proteins.

  • DB 구축일자

    2013-04-18

  • 초록 


    Chemical genomic approach for the functional genomics is in its adolescence. Thus, there are not many established methods availab...

    Chemical genomic approach for the functional genomics is in its adolescence. Thus, there are not many established methods available. In this project, we have carried out several techniques to elucidate new targets and to find out corresponding ligands at a time. Mainly, we have focused on affinity based selection of the selected chemicals, which has been known to be potential as commercially available drugs or physiologically active natural products. Stnadard genimic and proteomic approaches also were performed on selected chemicals such as actinocycin D and 2-benzoyloxyl cinammaldehyde (CB-Ph). For the affinity based approaches, we used affinity based selection of doxorubicin (anti-neoplastic agent), sialyl Lewis X (cancer cell marker), betulinic acid, Psammaplin A (anti-angiogenic agent) using phage-displayed protein or peptide libraries for target identification. With neomycin (antibiotics) and ferulic acid (anti-dermentia agent), second generation of derivatives were synthesized and showed the improved affinities against the target molecules, which were already identified by the affinity-based selection. With these approaches, we tried to identify the targets and get the corresponding ligands simultaneously to accelerate the drug discovery.
    Actinomycin D was screened as Grb2/SH2 domain blockers in an in vitro assay system and induced G1 arrest in cell cycle in B104-1-1 cells. CB-Ph has antitumor effects against a couple of human tumor cells including gastric cancer. We compared genes and protein expression profiles in compound-treated and untreated in cells using cDNA chip and proteomic analysis to unveil cellular regulatory mechanism of the biologically active compounds. After compound treatment, mRNA and cellular proteins were separated by various biological technologies and up and down-regulated genes and proteins identified with reported data bases. We found that these approaches are very useful to figure out the cellular mechanism of biologically active compounds and can also be applicable to study of functional genomics using small molecules.


    - Chemical genomic 방법의 forward genetics를 통해 새로운 표적을 밝히는 연구를 진행하였다.
    - Doxorubicin은 가장 많이 쓰이고 있는 항암제로서 T7 phage library와 biopann...

    - Chemical genomic 방법의 forward genetics를 통해 새로운 표적을 밝히는 연구를 진행하였다.
    - Doxorubicin은 가장 많이 쓰이고 있는 항암제로서 T7 phage library와 biopanning 방법을 이용하여 새로운 표적 후보인 hNopp140를 발견했다. Doxorubicin은 이 단백질에 KD = 4.5 x10(-6) M 정도로 결합하며 doxorubicin의 약효를 내게하는 단백질 중에 하나이다.
    - Sialyl Lewis X (sLeX)는 암세포에 특이적인 당이며 파지디스플레이 된 펩타이드를 이용하여 당에 특이적 단백질을 찾아냈다. 찾아진 단백질들은 tandem 펩타이드를 연속적으로 가지고 있었으며숙주를 공격하는데 꼭 필요한 세포 표면 단백질 들이었다. tandem 펩타이드를 모방한 tentacle 모양의 펩타이드는 암 세포 표면 당과 특이적이며 강한 결합력을 가졌다. 따라서 이들 펩타이드를 암의 진단이나 치료에 쓸 수 있다.
    - 천연물인 ferulic acid (FA) and styryl benzene (SB)는 b-sheet 이 풍부한 펩타이드 또는 단백질에 결합한다. FA와 SB를 모방한 새로운 이합체 화합물을 만들어 베타아밀로이드에 특이적으로 결합함을 검색하였다. 이들 중에는 단위체인 베타아밀로이드에 결합함으로서 fibril의 형성을 방해하는 화합물도 존재하였으며, 이들은 특히 베타아밀로이드의 올리고머 형성도 방해하여 치매 치료에 새로운 돌파구를 열만한 선도화합물을 도출하였다.
    - Neomycin (Neo)과 chloramphenicol/linezolid (Cam/Lnz)은 각각 RNA 표적의 stem과 loop에 결합한다. 이 두화합물을 결합한 Neo-Cam과 Neo-Lnz를 만들어 RNA 표적에 검색한 결과 그 결합력이 10-100정도 증가하였다. 이와 같은 현상은 의도대로 stem-특이적 화합물과 loop 특이적 화합물이 각 각stem과 loop에 결합하기 때문이며, 이 화합물을 통하여 특이적인 RNA 표적을 찾아낼 수 있다.
    - Betulinic acid (BetA)는 암세포 억제물질로서 혈관생성을 저해하는 것으로 알려져 있다. 이것미 토콘드리아의 기능에 영향을 주는 것으로 조사되었으며, 미토콘드리아 내의 여러 단백질과의 결합력 을 조사 중에 있다.
    - Psammaplin A (PsA)는 topoisomerase II 의 활성을 저해하여 항암효과를 지닌 것으로 알려졌다. 또한 PsA는 aminopeptidase N의 저해역할을 함으로서 신생혈관 생성을 억제하는 것으로 새롭게 조사되었다.
    - 천연물인 CB-Ph 는 항암 작용을 하는 화합물로 이것의 표적을 규명하기 위하여 gene-chip과 2DE를 실시하였다. 아직 뚜렷한 표적은 얻지 못했지만, apoptosis와 G1 arrest에 관계되는 프로세스 효소를 저해하는 것으로 조사되었다.


  • 목차(Contents) 

    1. 표지...2
    2. 제출문...3
    3. 보고서초록...5
    4. 요약문...6
    5. SUMMARY...8
    6. CONTENTS...10
    7. 목차...11
    8. ◆ 파아지 디스플레이 방법을 이용한 생리활성 천연물과 결합하는 단백질의 발굴 ...13
    9. 제1장 연구개발과제의 개요 ...1...
    1. 표지...2
    2. 제출문...3
    3. 보고서초록...5
    4. 요약문...6
    5. SUMMARY...8
    6. CONTENTS...10
    7. 목차...11
    8. ◆ 파아지 디스플레이 방법을 이용한 생리활성 천연물과 결합하는 단백질의 발굴 ...13
    9. 제1장 연구개발과제의 개요 ...13
    10. 제2장 국내외 기술개발 현황 ...14
    11. 제3장 연구개발수행 내용 및 결과 ...15
    12. 제4장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ...30
    13. 제5장 연구개발결과의 활용계획 ...31
    14. 제6장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ...31
    15. 제7장 참고문헌 ...32
    16. ◆ Sialyl Lewis X (sLeX)를 비롯한 여러 가지 당에 대한 펩타이드의 선택과 당 인식 표적 연구 ...33
    17. 제1장 연구개발과제의 개요 ...33
    18. 제2장 국내외 기술개발 현황 ...34
    19. 제3장 연구개발수행 내용 및 결과 ...35
    20. 제4장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ...44
    21. 제5장 연구개발결과의 활용계획 ...45
    22. 제6장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ...46
    23. 제7장 참고문헌 ...47
    24. ◆ beta-Amyloid 집적 방해 및 beta-Amyloid fibril 형성 방해 능력이 있는 화합물의 탐색 ...49
    25. 제1장 연구개발과제의 개요 ...49
    26. 제2장 국내외 기술개발 현황 ...50
    27. 제3장 연구개발수행 내용 및 결과 ...51
    28. 제4장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ...57
    29. 제5장 연구개발결과의 활용계획 ...59
    30. 제6장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ...59
    31. 제7장 참고문헌 ...60
    32. ◆ RNA 특이적 분자를 이용한 특이적 RNA의 발굴과 그 특이성의 탐구 ...61
    33. 제1장 연구개발과제의 개요 ...61
    34. 제2장 국내외 기술개발 현황 ...62
    35. 제3장 연구개발수행 내용 및 결과 ...62
    36. 제4장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ...73
    37. 제5장 연구개발결과의 활용계획 ...74
    38. 제6장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ...75
    39. 제7장 참고문헌 ...77
    40. ◆ 세포 주를 이용한 화학유전체 연구 (A Study of Chemical Genomics Using Cancer Cell Lines: 위탁연구, 생명공학연구원 권병목) ...79
    41. 제1장 연구개발과제의 개요 및 국내외 기술개발 현황 ...79
    42. 1. RaS pathway...79
    43. 2. Actinomucin D...80
    44. 3. 세포주기...82
    45. 4. 2´-Hydrpxycinnamaldehyde(HCA)...84
    46. 제2장 연구개발수행 내용 및 결과 및 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ...86
    47. 1. 실험 재료...86
    48. 2. 실험 방법...86
    49. 3. 결과 및 고찰...93
    50. 4. 2´-Hydrpxycinnamaldehyde에 의한 세포성장 억제 효과 및 세포주기 분석...105
    51. 5. HCA 처리에 의한 유전자 발현 변화 분석...107
    52. 6. HCA 처리에 의한 유전자 및 단백질 발현 변화 검증...114
    53. 제3장 결론 및 연구개발결과의 활용계획 ...116
    54. 1. Actinomucin D...116
    55. 2. 2´-Hydrpxycinnamaldehyde...117
    56. 제4장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 및 참고문헌 ...118
    57. ◆ Chemical Genomics를 이용한 생리활성 약물의 표적결정 연구 (Target Identification of Biologically Active Compounds Using Chemical Genomics: 위탁연구, 세종대학교 권호정) ...121
    58. 제1장 연구개발과제의 개요 ...121
    59. 1. 국외의 연구개발 현황...121
    60. 2. 국내의 기술동향 및 수준...121
    61. 제2장 국내외 기술개발 현황 ...121
    62. 제3장 연구개발수행 내용 및 결과 ...122
    63. 제4장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ...129
    64. 1. 연구개발목표의 달성도...129
    65. 2. 평가의 착안점에 따른 목표달성도에 대한 자체평가...129
    66. 3. 관련분야에 기여도...129
    67. 제5장 연구개발결과의 활용계획 ...130
    68. 제6장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ...130
    69. 제7장 참고문헌 ...131
  • 참고문헌

    1. 전체(0)
    2. 논문(0)
    3. 특허(0)
    4. 보고서(0)

 활용도 분석

  • 상세보기

    amChart 영역
  • 원문보기

    amChart 영역