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간암 및 전암성 병변의 진단 및 예후 바이오마커로서 DNA 메틸화 표지자개발 및 실용화기술 개발
Development of DNA methylation markers as diagnostic and prognostic markers for hepatocellular carcinoma and application technique

  • 과제명

    간암 및 전암성 병변의 진단 및 예후 바이오마커로서 DNA 메틸화 표지자개발 및 실용화기술 개발

  • 주관연구기관

    서울대학교
    Seoul National University

  • 보고서유형

    3단계보고서

  • 발행국가

    대한민국

  • 언어

    한국어

  • 발행년월

    2010-05

  • 과제시작년도

    2009

  • 주관부처

    과학기술부

  • 사업 관리 기관

    한국연구재단
    National Research Foundation of Korea

  • 등록번호

    TRKO201000012421

  • 과제고유번호

    1345097933

  • 키워드

    혈장,DNA메틸화,바이오마커,혈액진단,CpG 섬,간암Plasma,DNA methylation,biomarker,blood diagnosis,CpG island,liver cancer

  • DB 구축일자

    2013-04-18

  • 초록 


    Our project aimed to generate DNA methylation profiles in individual step lesions from normal liver- chronic hepatitis - liver ci...

    Our project aimed to generate DNA methylation profiles in individual step lesions from normal liver- chronic hepatitis - liver cirrhosis - hepatocellular carcinoma, to develop cancer-specific DNA methylation markers, to elucidate the correlation of CpG island hypermethylation with clinicopathological features of hepatocellular carcinoma and background liver condition, and to develop DNA methylation markers which herald poor prognosis of hepatocellular carcinoma patients. After accomplishing these goals, we analyzed methylation frequencies or levels of 60 DNA methylation markers in peripheral blood leukocyte DNAs and plsama DNAs from healthy volunteers and hepatocellular carcinoma patients. Then we determined candidate DNA methylation markers which distinguish hepatocellular carcinoma from normal healthy volunteers. With these candidate markers, we next screened methylation status in plasma DNAs from chronic hepatitis, liver cirrhosis, and hepatocellular carcinoma patients. Through statistical analyses, we developed DNA methylation marker panels to diagnosis hepatocellular carinoma on blood test with high specificity. These DNA methylation marker panels were demonstrated to have no relationship with serum AFP levels, which means that these methylation maker panels help to diagnose hepatocellular carcinoma with no AFP production. However, blood-based detection of HCC was not good on the aspect of sensitivity. Thus, future study will be directed to improve the sensitivity of DNA methylation-based detection of HCC in blood


    정상간-만성간염-간경화-간암에 이르는 다단계병변에서 56개 DNA메틸화마커의 메틸화빈도, 메틸화레벨, 메틸화패턴들을 파악하였으며, 간암특이적인 DNA메틸화마커를 발굴하였음. 또한 간암의 DNA메틸화에 영향을 주는 내재적 및 외부적 ...

    정상간-만성간염-간경화-간암에 이르는 다단계병변에서 56개 DNA메틸화마커의 메틸화빈도, 메틸화레벨, 메틸화패턴들을 파악하였으며, 간암특이적인 DNA메틸화마커를 발굴하였음. 또한 간암의 DNA메틸화에 영향을 주는 내재적 및 외부적 요인을 규명하였음. 여성이거나, 간암주위의 간실질이 간경화상태일 때, 간암의 발암원인이 HCV이거나, NBNC일 때 간암에 DNA메틸화가 많이 일어남을 밝혔음. 간암특이적인 DNA메틸화마커 중, CRABP1과 SYK의 메틸화는 환자의 불량한 예후와 밀접한 관계가 있었고, 이들은 독립적인 예후인자임을 밝힘. 만성간염상태에서 발생한 간암에 비해 간경화상태에서 발암한 간암이 더 많은 메틸화마커의 메틸화가 동반되어 있음을 밝힘으로써, 간암의 DNA메틸화는 배경의 간실질 상태가 어떤식으로든 관련이 있음을 최초로 밝힘. 또한, 남성에 비해 여성에서 발생한 간세포암이 더 많은 유전자의 DNA메틸화가 일어나 있음을 밝힘으로써, 성호르몬을 비롯한 여성 특유의 상황이 간세포암의 후성유전학적 변화에 영향을 끼침을 밝힘. Real time PCR-based methylation specific PCR방법인 MethyLight assay는 파라핀포매조직에서도 신선조직과 다름없는 실험결과를 보인다는 사실을 보여줌으로써, 후성유전학적 연구가 조직의 고정상태나 보관상태에 큰 영향을 받지 않음을 제시하였음. Illumina company의 Goldengate methylation solution을 이용하여 간암에 특이적인 새로운 DNA메틸화 마커를 추가적으로 발굴하였고, 이 마커들의 생물학적 의미를 밝히는 후속적인 연구를 지속적으로 수행하고 있음. 일반 정상인의 백혈구 DNA와 혈장 DNA를 대상으로 60개의 DNA메틸화마커에 대한 메틸화여부를 조사함으로써, 일반인의 혈액에서 정상적으로 검출될 수 있는 DNA메틸화마커를 파악하였고, 그런 연후, 간암혈장을 대상으로 60개의 DNA메틸화마커에 대해 메틸화상태를 MethyLight assay를 이용하여 조사하였고, 이를 통해 간암을 검출하는데 유용할 여지가 있는 DNA메틸화마커를 일차적으로 선별하였고, 이들 선별된 DNA메틸화마커를 만성간염, 간경변, 간암환자의 혈장 DNA를 대상으로 다시 메틸화검사를 시행하였고, 이를 통해 간암을 진단할 수 있는 DNA메틸화마커패널을 결정하였다


  • 목차(Contents) 

    1. 표지 ... 1
    2. 제출문 ... 2
    3. 보고서 초록 ... 3
    4. 요약문 ... 4
    5. SUMMARY ... 6
    6. CONTENTS ... 7
    7. 목차 ... 8
    8. 제1장 연구개발과제의 개요 ... 9
    9. * 연구개발의 목적, 필요성 및 범위 등을 기술 ... 9...
    1. 표지 ... 1
    2. 제출문 ... 2
    3. 보고서 초록 ... 3
    4. 요약문 ... 4
    5. SUMMARY ... 6
    6. CONTENTS ... 7
    7. 목차 ... 8
    8. 제1장 연구개발과제의 개요 ... 9
    9. * 연구개발의 목적, 필요성 및 범위 등을 기술 ... 9
    10. 제2장 국내외 기술개발 현황 ... 14
    11. * 국내.외 관련분야에 대한 기술개발현황과 연구결과가 국내.외 기술개발현황에서 차지하는 위치 등을 기술 ... 14
    12. 제3장 연구개발수행 내용 및 결과 ... 17
    13. * 이론적, 실험적 접근방법, 연구내용, 연구결과를 기술 ... 17
    14. 제4장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ... 30
    15. * 연도별 연구목표 및 평가착안점에 입각한 연구개발목표의 달성도 및 관련분야의 기술발전에의 기여도 등을 기술 ... 30
    16. 제5장 연구개발결과의 활용계획 ... 35
    17. * 추가연구의 필요성, 타연구에의 응용, 기업화 추진방안을 기술 ... 35
    18. * 연구기획사업 등 사업별 특성에 따라 목차는 변경 가능함 ... 35
    19. 제6장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 36
    20. 제7장 참고문헌 ... 37
    21. 끝페이지 ... 39
  • 참고문헌

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