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보고서 상세정보

동위원소를 이용한 프로테옴의 초고속 정량화 연구
Development of High ThroughputQuantitation of Proteomes with Isotopes

  • 사업명

    21세기프론티어연구개발사업

  • 과제명

    동위원소를 이용한 프로테옴의 초고속 정량화 연구

  • 주관연구기관

    한국기초과학지원연구원
    Korea Basic Science Institute

  • 연구책임자

    유종신

  • 참여연구자

    김현식   이주연   권경훈   안영희   김진영   박건욱   조건   지은선   이지연   허만회   이정화   ...  

  • 보고서유형

    2단계보고서

  • 발행국가

    대한민국

  • 언어

    한국어

  • 발행년월

    2008-05

  • 과제시작년도

    2007

  • 주관부처

    과학기술부

  • 사업 관리 기관

    한국과학재단
    Korea Science and Engineering Foundtion

  • 등록번호

    TRKO201000012595

  • 과제고유번호

    1355049686

  • 키워드

    인산화단백질.질량분석.화학적 표지.동위원소 치환.정량분석.phosphoprotein.mass spectrometry.chemical labeling.isotope label.Quantitat.

  • DB 구축일자

    2013-04-18

  • 초록 


    A highly mass-sensitive labeling tag, guanidinoethanethiol (GET), was developed for analysis of phosphopeptides derived from phos...

    A highly mass-sensitive labeling tag, guanidinoethanethiol (GET), was developed for analysis of phosphopeptides derived from phosphoproteins of highly complex biological samples. The developed method, which is using a phospho-specific chemical labeling reaction following β-elimination and Michael addition, was validated as a highly sensitive labeling tool, especially in the analysis using matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry, and further improved for quantitative analysis of phosphoproteome. The GET-labeling method was coupled efficiently with iTRAQ tagging method for quantitative analysis of phosphopeptides. For the analysis of mass data obtained from ITRAQ/GET-labeled peptide sample a new peptide sequencing and scoring algorism was developed and validated using mass data coming from mass analysis of GET-labeled or iTRAQ/GET-labeled peptides. Affinity enrichment for phosphopeptides using titania could also be conducted successfully before the chemical labelings of peptide mixture. Using the smartly integrated system for highly sensitive and quantitative mass analysis of phosphopeptides, complex phosphoproteome sample derived from human colorectal tumor was analyzed, and lots of phosphopeptide showing differential abundance between normal and tumor samples were identified and quantified. The GET-labeling technique was patented in some major regions including Korea, USA, EU etc.


    고감도의 질량분석 표지물질인 GET를 개발 및 한국, 유럽 및 미국 등에 특허등록 하고 이를 바탕으로 하여, 동위원소를 이용하는 인산화단백질 정량법을 확립함. 개발된 분석법을 활용하여 인산화단백질의 정성, 정량 질량분석을 위한, 고...

    고감도의 질량분석 표지물질인 GET를 개발 및 한국, 유럽 및 미국 등에 특허등록 하고 이를 바탕으로 하여, 동위원소를 이용하는 인산화단백질 정량법을 확립함. 개발된 분석법을 활용하여 인산화단백질의 정성, 정량 질량분석을 위한, 고감도 질량분석 시스템을 구축함.
    GET 표지방법을 ITRAQ 분석법과 결합하여, 인산화단백질에 대한 고감도 정성 및 정량분석 기술을 개발함.
    GET 표지법 및 동위원소 치환법을 이용한 정량분석 시스템 최적화 및 자동화에 의한 대장암 유발 대량의 정량분석 데이터 생산하는데 활용함. 또한 동위원소 치환된 GET-표지화 단백질 검색용 스코어링 업그레이드에 의해 GET-표지화 단백질의 정량질량분석 데이터의 해석에 활용.
    인산화 아미노산 잔기에 대한 표지반응을 수행하여, 아미노산 잔기를 가수분해효소가 인식할 수 있는 구조를 갖는 표지된 잔기로 바꾸어 줌으로써, 기존의 인산화 아미노산 잔기에서 가수분해 반응을 유도할 수 있게 되었음. 향후 생물학적으로 응용 가능성이 큼.
    GET 표지물질의 사용 방법은 한국 및 미국, 유럽, 일본에 특허출원하여 우선권을 확보하였고 선진국에서의 특허등록을 (미국특허등록, US 7250266, 2007년) 통하여 향후 본 기술의 응용 및 상용화에도 국제 경쟁력을 확보하고 있다고 판단됨.


  • 목차(Contents) 

    1. 표지 ...2
    2. 제출문 ...3
    3. 보고서 초록 ...4
    4. 요약문 ...5
    5. SUMMARY ...7
    6. CONTENTS ...8
    7. 목차 ...9
    8. 제1장 연구개발과제의 개요 ...10
    9. 제2장 국내외 기술개발 현황 ...11
    10. 제3장 연구개발수행 내...
    1. 표지 ...2
    2. 제출문 ...3
    3. 보고서 초록 ...4
    4. 요약문 ...5
    5. SUMMARY ...7
    6. CONTENTS ...8
    7. 목차 ...9
    8. 제1장 연구개발과제의 개요 ...10
    9. 제2장 국내외 기술개발 현황 ...11
    10. 제3장 연구개발수행 내용 및 결과 ...12
    11. 1절 고감도 질량분석 표지물질 GET의 개발 ...12
    12. 2절 표지물질 GET을 이용한 겔-내 인산화단백질 분석기술 ...14
    13. 3절 GET표지된 인산화단백질 질량분석 data 처리기술 개발 ...16
    14. 4절 동위원소로 치환된 GET표지를 이용한 인산화단백질 정량분석 ...17
    15. 5절 GET 및 iTRAQ를 활용한 인산화단백질 정량분석기술 개발 ...18
    16. 6절 GET 및 iTRAQ를 활용한 정량분석 data 처리기술 개발 ...21
    17. 7절 표지된 인산화단백질의 농축 및 초고속 정량분석 기술개발 ...23
    18. 제4장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ...30
    19. 제5장 연구개발결과의 활용계획 ...35
    20. 제6장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ...37
    21. 제7장 참고문헌 ...38
  • 참고문헌

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