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콩(Glycine max)에서 뿌리혹 특이적 EST 분석을 통한 유용유전자 대량 탐색
High throughput screening of useful genes by analyzing the nodule-specific EST from Soybean

  • 연구책임자

    안정선

  • 참여연구자

    이형석   오창재   김여주  

  • 보고서유형

    1단계보고서

  • 발행국가

    대한민국

  • 언어

    한국어

  • 발행년월

    2004-08

  • 주관부처

    과학기술부

  • 등록번호

    TRKO201000012639

  • 키워드

    뿌리혹.질소고정.콩.cDNA microarray.EST.cDNA microarray.EST.nitrogen fixation.root nodule.soybean.

  • DB 구축일자

    2013-04-18

  • 초록 


    1) Construction of full-length cDNA library for root nodule and its EST database. cDNA library specific for the root nodule of so...

    1) Construction of full-length cDNA library for root nodule and its EST database. cDNA library specific for the root nodule of soybean will be constructed by using mRNAs from root nodules 2, 5, and 10 weeks after innoculation with symbiont Rhizobium strain. In three years, 4,000 unique cDNA clones, 100 clones with complete sequence and 25 candidate useful clones will be included in the EST database by partial sequencing and bioinformatics of 10,000 clones.
    2) Pilot cDNA chip construction for the in mass analysis of expression patterns. Non-repetitive clones will be used for the construction of DNA chip for the latter use.


    - 생태계 질소원의 대부분을 공급하는 콩과식물-Rhizobium 간의 공생관계는 뿌리혹을 통해 이루어짐.
    - 뿌리혹 발달에 관여하는 유용유전자의 대량탐색은 질소고정의 효율적 이용을 위해 필수적인 과정.
    □따라서 본 연구에...

    - 생태계 질소원의 대부분을 공급하는 콩과식물-Rhizobium 간의 공생관계는 뿌리혹을 통해 이루어짐.
    - 뿌리혹 발달에 관여하는 유용유전자의 대량탐색은 질소고정의 효율적 이용을 위해 필수적인 과정.
    □따라서 본 연구에서는 다음과 같은 과정을 수행하였음.
    - 콩을 Bradyrhizobium japonicum USDA110으로 감염시킨 후 세 가지 서로 다른 뿌리혹 발달 단계로부터 cDNA library를 제작
    - 5,469 개의 cDNA 클론 sequencing을 수행하여 2,511 개 non-redundant (nr) EST database를 구축
    - in silico 분석을 통해 뿌리혹에서 발현이 증가할 것으로 예상되는 382 개 cDNA 클론으로 구성된 cDNA microarray를 제작
    - cDNA microarray 분석 결과, 뿌리혹 발달 과정동안 발현이 증가하는 58 개 유전자를 선별
    이들 유전자는 기존에 알려진 nodulin 유전자, 탄소와 질소대사 관련유전자, 그리고 단백질 분해관련 유전자 등으로 밝혀짐.


  • 목차(Contents) 

    1. 제출문 ... 1
    2. 보고서초록 ... 2
    3. 요약문 ... 3
    4. SUMMARY ... 5
    5. CONTENTS ... 7
    6. 목차 ... 8
    7. 제1장 연구개발과제의 개요 ... 9
    8. 제1절 연구개발의 목적 ... 9
    9. 제2절 연구개발의 ...
    1. 제출문 ... 1
    2. 보고서초록 ... 2
    3. 요약문 ... 3
    4. SUMMARY ... 5
    5. CONTENTS ... 7
    6. 목차 ... 8
    7. 제1장 연구개발과제의 개요 ... 9
    8. 제1절 연구개발의 목적 ... 9
    9. 제2절 연구개발의 필요성 ... 9
    10. 제3절 연구개발의 범위 ... 10
    11. 제2장 국내외 기술개발 현황 ... 12
    12. 제1절 국외 연구개발 실적 ... 12
    13. 제2절 국내 연구개발 실적 ... 12
    14. 제3장 연구개발 수행 내용 및 결과 ... 14
    15. 제1절 결과 ... 14
    16. 제2절 토의 ... 21
    17. 제4장 목표 달성도 및 관련분야에의 기여도 ... 25
    18. 제1절 연구개발 목표 달성도 ... 25
    19. 제2절 관련분야에의 기술 발전 기여도 ... 25
    20. 제5장 연구개발결과의 활용계획 ... 28
    21. 제6장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 28
    22. 제1절 조직특이적 EST 프로젝트 ... 28
    23. 제2절 식물체를 이용한 cDNA microarray ... 28
    24. 제3절 EST databases ... 28
    25. 제7장 참고문헌 ... 29
  • 참고문헌

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