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단백질의 핵심구조요소들에 대한 구조적 선호와 구조간 변형
Conformational Preferences and Transitions of Structural Motifs of Proteins

  • 사업명

    일반연구자지원

  • 과제명

    단백질의 핵심구조요소들에 대한 구조적 선호와 구조간 변형

  • 주관연구기관

    충북대학교
    Chungbuk National University

  • 연구책임자

    강영기

  • 보고서유형

    최종보고서

  • 발행국가

    대한민국

  • 언어

    한국어

  • 발행년월

    2010-04

  • 과제시작년도

    2009

  • 주관부처

    교육과학기술부

  • 사업 관리 기관

    한국연구재단

  • 등록번호

    TRKO201000013115

  • 과제고유번호

    1345104070

  • 키워드

    생리활성 펩타이드.구조적 선호.구조간 변형.DFT 계산.용매효과.분자설계.bioactive peptides.conformational preferences.DFT calculations.solvation effects.molecular modeling.dispersion-corrected DFTs.

  • DB 구축일자

    2013-04-18

  • 초록 


    Using the dispersion-corrected DFT methods, the conformational analysis of the proline analogues of imidazolidine-2-carboxylic ac...

    Using the dispersion-corrected DFT methods, the conformational analysis of the proline analogues of imidazolidine-2-carboxylic acid (2-Imd) and imidazolidine-5-carboxylic acid (5-Imd) with the 3(R) and 3(S) stereochemical substituents has been carried out in the gas phase and in water, from which the backbone populations, prolyl cis-trans isomerization, and thermodynamic properties have been analyzed. In addition, the conformational role of these Imd residues in popyproline II and I structures has been investigated for Ac-$(Pro)_5-NMe_2$, of which the third Pro is replaced by one of these Imd residues.


    Dispersion을 보정한 양자화학적 DFT 계산방법을 사용하여, Pro 잔기의 유도체인 imidazolidine-2-carboxylic acid (2-Imd)와 imidazolidine-5-carboxylic acid(5-Imd...

    Dispersion을 보정한 양자화학적 DFT 계산방법을 사용하여, Pro 잔기의 유도체인 imidazolidine-2-carboxylic acid (2-Imd)와 imidazolidine-5-carboxylic acid(5-Imd)가 3(R)과 3(S) 위치의 입체화학구조를 가지는 잔기들에 대한 구조분석 연구를 수행하고, 이들 Imd 잔기들의 backbone 구조 분포, prolyl cis-trans 이성질화 속도와 rotational barriers가 Pro 잔기의 값들과 차이를 만드는 요인들을 규명하였다. 또한 이 Imd 잔기들이 polyproline의 구조와 열역학 성질에 미치는 영향을 파악하고자, polyproline II와 I 구조를 가지는 Ac-$(Pro)_5-NMe_2$의 중앙에 위치하는 Pro 잔기 대신에 4가지 Imd 잔기를 치환한 펩타이드들의 구조분석 연구를 수행하였다. 특히, 최근에 개발된 long range와 dispersion을 보정한 여러 DFT 계산방법 중에서 실험으로 얻은 Ac-Ala-NHMe와 Ac-Pro-NHMe의 수용액상에서 구조선호를 가장 잘 재현하는 계산방법을 선정하여, Imd 잔기를 포함하는 펩타이드들의 구조분석 연구에 사용하였다.


  • 목차(Contents) 

    1. 표지...1
    2. 목차 ...2
    3. Ⅰ. 연구 계획 요약문...3
    4. 1. 국문 요약문...3
    5. Ⅱ. 연구 결과 요약문...4
    6. 1. 국문 요약문...4
    7. 2. 영문 요약문...5
    8. Ⅲ. 연구내용 및 결과...6
    9. 1. 연구개발과제의 개요 ...6...
    1. 표지...1
    2. 목차 ...2
    3. Ⅰ. 연구 계획 요약문...3
    4. 1. 국문 요약문...3
    5. Ⅱ. 연구 결과 요약문...4
    6. 1. 국문 요약문...4
    7. 2. 영문 요약문...5
    8. Ⅲ. 연구내용 및 결과...6
    9. 1. 연구개발과제의 개요 ...6
    10. 2. 국내외 기술개발 현황 ...6
    11. 3. 연구수행 내용 및 결과 ...7
    12. 4. 목표 달성도 및 관련 분야에의 기여도 ...19
    13. 5. 연구결과의 활용계획 ...20
    14. 6. 연구과정에서 수집한 해외과학기술 정보 ...20
    15. 7. 주관연구책임자 대표적 연구 실적 ...21
    16. 8. 참고 문헌 ...21
    17. 9. 연구 성과 ...23
    18. 10. 기타사항...23
    19. 별첨1 대표연구성과 ...24
    20. 별첨2...25
    21. 별첨3...55
  • 참고문헌

    1. 전체(0)
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