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암세포 특이적 표지 유전자의 발견을 위한 마이크로어레이 데이터의 수집, 통합, 마이닝 기법에 대한 연구
Research on collection and integration of microarray data and data mining methods for cancer-specific marker gene identification

  • 사업명

    특정기초연구지원사업

  • 과제명

    암세포 특이적 표지 유전자의 발견을 위한 마이크로어레이 데이터의 수집, 통합, 마이닝 기법에 대한 연구

  • 주관연구기관

    한림대학교 산학협력단

  • 연구책임자

    윤지희

  • 보고서유형

    최종보고서

  • 발행국가

    대한민국

  • 언어

    한국어

  • 발행년월

    2009-04

  • 과제시작년도

    2007

  • 주관부처

    과학기술부

  • 사업 관리 기관

    한국과학재단
    Korea Science and Engineering Foundtion

  • 등록번호

    TRKO201000013196

  • 과제고유번호

    1355049664

  • 키워드

    데이터 통합.유전자 온토로지.마이크로어레이 데이터.데이터 마이닝.표지 유전자.발현 유전자군.Data Integration.Gene Ontotlogy.Microarray Data.Data Mining.Marker Gene.Gene Expression Group.

  • DB 구축일자

    2013-04-18

  • 초록 


    In microarray experiments, increased sample size improves both the accuracy and significance of classification results. However r...

    In microarray experiments, increased sample size improves both the accuracy and significance of classification results. However results obtained using microarray data generated from different technologies, such as spotted cDNA and Affymetrix arrays, may show poor correlation and cannot be compared directly. Even when using the same microarray technology, different generations of microarrays have different probe sets and experimental protocols, making direct integration difficult. In this study, in order to identify marker genes to discriminate cancer conditions from normal, we develop the following core series of methods which collect, integrate, and mine microarray data from disparate experiments.


    마이크로어레이 실험에서는 사용된 샘플의 숫자가 클수록 분석 자료의 신뢰도가 높아진다. 그러나 동일한 마이크로어레이를 사용했다 하더라도, 실험 조건이 다른 경우 이를 통합하는 솔루션이 완전하지 않으며, 특히 다른 회사의 마이크로어레이...

    마이크로어레이 실험에서는 사용된 샘플의 숫자가 클수록 분석 자료의 신뢰도가 높아진다. 그러나 동일한 마이크로어레이를 사용했다 하더라도, 실험 조건이 다른 경우 이를 통합하는 솔루션이 완전하지 않으며, 특히 다른 회사의 마이크로어레이를 사용하는 경우에는 이를 통합하여 분석하는데 많은 문제점이 있다. 본 연구에서는 암조직 특이적 표지 유전자군을 발굴하기 위하여, 플랫폼이 상이한 마이크로어레이 데이터를 수집, 통합, 마이닝하는 다음의 핵심 기법을 개발하였다.


  • 목차(Contents) 

    1. 제출서 ...1
    2. 목차 ...2
    3. I. 연구계획 요약문 ...3
    4. 1. 국문요약문 ...3
    5. II. 연구결과 요약문 ...4
    6. 1. 국문요약문 ...4
    7. 2. 영문요약문 ...5
    8. III. 연구내용 및 결과 ...6
    9. 1. 연구개발과제의개요 ...6<...
    1. 제출서 ...1
    2. 목차 ...2
    3. I. 연구계획 요약문 ...3
    4. 1. 국문요약문 ...3
    5. II. 연구결과 요약문 ...4
    6. 1. 국문요약문 ...4
    7. 2. 영문요약문 ...5
    8. III. 연구내용 및 결과 ...6
    9. 1. 연구개발과제의개요 ...6
    10. (1) 연구 개발의 목적 ...6
    11. (2) 연구 개발의 필요성 ...6
    12. (3) 연구 개발의 범위 ...6
    13. 2. 국내외 기술개발 현황 ...7
    14. 3. 연구수행 내용 및 결과 ...8
    15. 3.1 GO 기반의 MicroArray 데이터 분석에 의한 유전자군의 기능적 분류 및 검색 ...8
    16. 3.2 암 조직 실험을 통한 MicroArray 데이터 생성 및 검증 ...24
    17. 3.3 통합 MicroArray DB구축 및 표지 유전자 발견을 위한 마이닝 기법의 개발 ...29
    18. 4. 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ...40
    19. 4.1 연구개발 목표의 달성도 ...40
    20. 4.2 관련 분야의 기여도 ...41
    21. 5. 연구결과의 활용계획 ...42
    22. 6. 연구과정에서 수집한 해외과학기술정보 ...42
    23. 7. 주관연구책임자 대표적 연구실적 ...44
    24. 8. 참고문헌 ...44
    25. 9. 연구성과 ...46
    26. 10. 기타사항 ...50
    27. [별첨1] 대표연구성과 ...51
  • 참고문헌

    1. 전체(0)
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