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보고서 상세정보

대장균과 살모넬라에서의 ppGpp 결합 단백질 연구
ppGpp-binding proteins in Escherichia coli and Salmonella typhimurium

  • 사업명

    일반연구자지원

  • 과제명

    대장균과 살모넬라에서의 ppGpp 결합 단백질 연구

  • 주관연구기관

    전남대학교
    Chonnam National University

  • 연구책임자

    정제훈

  • 보고서유형

    최종보고서

  • 발행국가

    대한민국

  • 언어

    한국어

  • 발행년월

    2010-04

  • 과제시작년도

    2009

  • 주관부처

    교육과학기술부

  • 사업 관리 기관

    한국연구재단

  • 등록번호

    TRKO201000013320

  • 과제고유번호

    1345104976

  • 키워드

    결핍 반응.단백체학.친화성 단백체학.ppGpp.stringent response.proteomics.affinity proteomics.

  • DB 구축일자

    2013-04-18

  • 초록 


    Due to the reduced period of support, the works below have been done. All of the experiemnts in the agreement have been accomplis...

    Due to the reduced period of support, the works below have been done. All of the experiemnts in the agreement have been accomplished as planned.
    $\bullet$ Preparation of ribosomal fraction for ppGpp synthesis
    $\bullet$ Synthesis and purification of ppGpp
    $\bullet$ Immobilization of ppGpp and GDP to Sepharose
    $\bullet$ Affinity chromatography with immobilized ppGpp, GDP, and GTP
    $\bullet$ Further separation of the bound proteins by 2-dimensional gel electrophoresis
    $\bullet$ Identification of bound proteins by MALDI-TOF MS
    $\bullet$ Identification by LC/MSMS after trypsin hydrolysis (shotgun analysis)
    $\bullet$ Comparison of the bound proteins between ligands employed
    $\bullet$ Comparison between ppGpp and GDP will be related with the specificity of the pyrophosphate at 3'-hydroxyl group.
    $\bullet$ ppGpp and GTP will be compared for verifying the method employed in this study


    지원 기간 축소에 따라 본래 계획 중 다음과 같은 연구를 수행하기로 협약 과정에서수정한 바 있으며, 수정 계획서 상의 연구를 계획대로 모두 완료했음.
    $\bullet$ ppGpp 합성 효소 준비
    ...

    지원 기간 축소에 따라 본래 계획 중 다음과 같은 연구를 수행하기로 협약 과정에서수정한 바 있으며, 수정 계획서 상의 연구를 계획대로 모두 완료했음.
    $\bullet$ ppGpp 합성 효소 준비
    $\bullet$ ppGpp 합성 및 정제
    $\bullet$ ppGpp와 GDP를 고정화하여 affinity column 제작
    $\bullet$ 고정화된 ppGpp, GDP, GTP를 affinity ligand로 사용하여 affinity chromatography
    $\bullet$ 각 ligand에 결합하는 단백질을 이차원 전기영동과 MALDI-TOF MS로 동정함
    $\bullet$ 결합 단백질 혼합물을 trypsin으로 처리한 후 LC/MSMS로 동정함(shotgun analysis)
    $\bullet$ 동정된 단백질을 ligand 변화에 따른 차이점 비교 분석
    $\bullet$ ppGpp와 GDP의 비교는 3'-hydroxyl group에 존재하는 인산기의 차이에 따른 특이성을 관찰할 수 있음
    $\bullet$ GTP와 ppGpp의 비교는 본 접근법의 타당성 검토에 도움됨


  • 목차(Contents) 

    1. 일반연구자지원사업 최종보고서(초안) ...1
    2. 목차 ...2
    3. Ⅰ. 연구 계획 요약문 ...3
    4. 1. 국문 요약문 ...3
    5. Ⅱ. 연구 결과 요약문 ...4
    6. 1. 국문 요약문 ...4
    7. 2. SUMMARY...5
    8. Ⅲ. 연구 내용 ...6
    9. 1. 연...
    1. 일반연구자지원사업 최종보고서(초안) ...1
    2. 목차 ...2
    3. Ⅰ. 연구 계획 요약문 ...3
    4. 1. 국문 요약문 ...3
    5. Ⅱ. 연구 결과 요약문 ...4
    6. 1. 국문 요약문 ...4
    7. 2. SUMMARY...5
    8. Ⅲ. 연구 내용 ...6
    9. 1. 연구 개발 과제의 개요 ...6
    10. 2. 국내외 기술 개발 현황 ...9
    11. 3. 연구 수행 내용 및 결과 ...10
    12. 4. 목표 달성도 및 관련 분야에의 기여도 ...13
    13. 5. 연구 결과의 활용 계획 ...13
    14. 6. 연구 과정에서 수집한 해외 과학기술 정보 ...14
    15. 7. 주관연구책임자 대표적 연구 실적 ...14
    16. 8. 참고 문헌 ...15
    17. 9. 연구 성과 ...15
    18. 10. 기타 성과 ...15
  • 참고문헌

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