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보고서 상세정보

효모 모델 시스템의 네트쿼크 분석을 통한 약물 작용 기전 예측 알고리즘 개발

  • 사업명

    미래기반기술개발

  • 과제명

    효모 모델 시스템의 네트워크 분석을 통한 약물 작용기전 예측 알고리즘 개발

  • 주관연구기관

    한국과학기술원
    Korea Advanced Institute of Science and Technology

  • 연구책임자

    김동섭

  • 참여연구자

    이소영   정찬석   이민호   박근완   정인경   강효아  

  • 보고서유형

    최종보고서

  • 발행국가

    대한민국

  • 언어

    한국어

  • 발행년월

    2010-06

  • 과제시작년도

    2009

  • 주관부처

    교육과학기술부

  • 사업 관리 기관

    한국연구재단

  • 등록번호

    TRKO201000013678

  • 과제고유번호

    1345101296

  • 키워드

    유전체 적중.분열호모.출아효모.화학유전체 프로파일.네트워크 모델링.gene deletion.fission yeasxt.budding yeast.chemical-genomic profile.network modeling.

  • DB 구축일자

    2013-04-18

  • 초록 


    The chemical-genetic profile can be defined as quantitative values of deletion strains' growth defects under exposure to chemical...

    The chemical-genetic profile can be defined as quantitative values of deletion strains' growth defects under exposure to chemicals. In yeast, the compendium of chemical-genetic profiles of genomewide deletion strains under many different chemicals has been used for identifying direct target proteins and a common mode-of-action of those chemicals. In the previous study, valuable biological information such as protein?protein and genetic interactions has not been fully utilized. In our study, we integrated this compendium and biological interactions into the comprehensive collection of ~490 protein complexes of yeast for model-based prediction of a drug's target proteins and similar drugs. We assumed that those protein complexes (PCs) were functional units for yeast cell growth and regarded them as hidden factors and developed the PC-based Bayesian factor model That relates the chemical-genetic profile at the level of organism phenotypes to the hidden activities of PCs at the molecular level. The inferred PC activities provided the predictive power of a common mode-of-action of drugs as well as grouping of PCs with similar functions. In addition, our PC-based model allowed us to develop a new effective method to predict a drug's target pathway, by which we were able to highlight the target-protein, TOR1, of rapamycin. Our study is the first approach to model phenotypes of systematicdeletion strains in terms of protein complexes. We believe that our PC-based approach can provide an appropriate framework for combining and modeling several types of chemical-genetic profiles including interspecies. Such efforts will contribute to predicting more precisely relevant pathways including target proteins that interact directly with bioactive compounds.


    1. 공개된 또는 공동연구팀의 공동 작업을 통해 새로이 생성한 화학유전체 프로파일을 체계적으로 DB화 2. DB화 된 프로파일을 이용하여 효모 생체 네트워크에 기반을 둔 분석 모델을 개발 3. 분석모델을 이용하여 보다 정교한 효모 ...

    1. 공개된 또는 공동연구팀의 공동 작업을 통해 새로이 생성한 화학유전체 프로파일을 체계적으로 DB화 2. DB화 된 프로파일을 이용하여 효모 생체 네트워크에 기반을 둔 분석 모델을 개발 3. 분석모델을 이용하여 보다 정교한 효모 생체 네트워크 모델을 개발 4. 분석모델을 바탕으로 기존에 기능이 잘 알려지지 않은 천연물의 세포내 기능을 예측하고 기존 약물이 세포 성장에 미치는 특이적인 저해 기전을 규명


  • 목차(Contents) 

    1. 제출문 ...1
    2. 보고서 요약서 ...2
    3. 요약문 ...3
    4. SUMMARY ...5
    5. CONTENTS ...6
    6. 목차 ...7
    7. 제1장 연구개발과제의 개요 ...8
    8. 제1절 연구개발의 목적...8
    9. 제2절 연구개발의 필요성...8
    10. 제2장 국...
    1. 제출문 ...1
    2. 보고서 요약서 ...2
    3. 요약문 ...3
    4. SUMMARY ...5
    5. CONTENTS ...6
    6. 목차 ...7
    7. 제1장 연구개발과제의 개요 ...8
    8. 제1절 연구개발의 목적...8
    9. 제2절 연구개발의 필요성...8
    10. 제2장 국내외 기술개발 현황 ...15
    11. 제1절 국내?외 관련분야에 대한 기술개발현황...15
    12. 제2절 현기술상태의 취약성...17
    13. 제3장 연구개발수행 내용 및 결과 ...19
    14. 제4장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ...40
    15. 제5장 연구개발결과의 활용계획 ...44
    16. 제6장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ...45
    17. 제7장 참고문헌 ...46
  • 참고문헌

    1. 전체(0)
    2. 논문(0)
    3. 특허(0)
    4. 보고서(0)

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