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보고서 상세정보

이질적 오믹스 실험 데이터의 총체적 분석 방법 개발 및 모델 시스템에 적용
Development of a data integration method for heterogeneous omics data and its application to a mammalian model system

  • 사업명

    바이오기술개발사업

  • 과제명

    이질적 오믹스 실험 데이터의 총체적 분석 방법 개발 및모델 시스템에 적용

  • 주관연구기관

    포항공과대학교 산학협력단

  • 연구책임자

    황대희

  • 보고서유형

    최종보고서

  • 발행국가

    대한민국

  • 언어

    한국어

  • 발행년월

    2010-08

  • 과제시작년도

    2007

  • 주관부처

    과학기술부

  • 사업 관리 기관

    한국과학재단
    Korea Science and Engineering Foundtion

  • 등록번호

    TRKO201000014490

  • 과제고유번호

    1355048759

  • 키워드

    오믹스 데이터.데이터 통합.다이나믹 네트워크 모델.시스템 생명학.소프트웨어.인산화단백체.선천면역.전사귀환 기작.Omics data.Data integration.Dynamic network model.Systems biology.software.Phosphoproteome.Innate immunity.Transcription feedback.

  • DB 구축일자

    2013-04-18

  • 초록 


    The goal of this project is to develop a methodology for integrating multiple types of omics data and then to apply it to integra...

    The goal of this project is to develop a methodology for integrating multiple types of omics data and then to apply it to integrate genomic, transcriptomic, and proteomic datasets generated from macrophages activated by pathogen associated patterns (PAMs). From this application, we could have identified key regulatory factors and their associated pathways for innate responses in macrophages. These findings can be used to identify drug targets for various types of immunotherapy that involves inhibition of macrophages.


    ● 오믹스 (유전체, 전사체,단백체) 실험데이터 생산 및 수집
    - 선천면역 시스템에서의 전사귀환 기작을 이해하기 위한 실험디자인에 따른 유전체, 전사체 데이터 수집 및 인산단백체 데이터 생산
    ● 데이터 통합에 필요한 알고...

    ● 오믹스 (유전체, 전사체,단백체) 실험데이터 생산 및 수집
    - 선천면역 시스템에서의 전사귀환 기작을 이해하기 위한 실험디자인에 따른 유전체, 전사체 데이터 수집 및 인산단백체 데이터 생산
    ● 데이터 통합에 필요한 알고리즘 및 소프트웨어 개발
    - 오믹스 (유전체/전사체/단백체) 데이터 분석을 위한 기본 툴 수집 및 개발
    - 데이터통합 프레임웍 및 이질적 데이터들의 통합에 필요한 알고리즘 개선 및 개발
    - 수집/개발된 툴 및 알고리즘을 통합하여 소프트웨어 개발 후 문제점 보완 및 개선
    ● 생체시스템에 데이터통합 소프트웨어 응용 및 유용성 검증
    - 전사체/인산화단백체 데이터로부터 라이간드 활성에 의해 변하는 유전자,단백질 동정
    - 인산화정도가 변하는 전사인자와 유전자 타깃들의 관계 동정 및 전사인자/유전자 타겟 관계에 대한 네트워크 모델 구축/분석을 통한 선천면역 시스템에서의 주요 생명현상에 대한 전사귀환 기작 가설 수립
    - 분자생물학적인 방법을 이용하여 기작에 대한 가설 검증


  • 목차(Contents) 

    1. 최종보고서 서식...1
    2. 표지 ...2
    3. 제출문 ...3
    4. 보고서 요약서...4
    5. 한글 요약문 ...5
    6. 영문 요약문 ...6
    7. contents ...6
    8. 제1장 연구개발과제의 개요 ...7
    9. 제1절 연구 개발의 과학기술, 사회경제적 중요성 ......
    1. 최종보고서 서식...1
    2. 표지 ...2
    3. 제출문 ...3
    4. 보고서 요약서...4
    5. 한글 요약문 ...5
    6. 영문 요약문 ...6
    7. contents ...6
    8. 제1장 연구개발과제의 개요 ...7
    9. 제1절 연구 개발의 과학기술, 사회경제적 중요성 ...7
    10. 제2장 국내외 기술개발 현황 ...10
    11. 제3장 연구개발수행 내용 및 결과 ...12
    12. 제1절 이론적, 실험적 접근방법 ...12
    13. 제2절 연구수행 내용 및 결과 ...14
    14. 제4장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ...24
    15. 제1절 연구개발목표의 달성도 ...24
    16. 제2절 관련분야의 기술발전에의 기여도 ...27
    17. 제3절 연구개발의 최종목표 및 연구내용 ...27
    18. 제5장 연구개발결과의 활용계획 ...32
    19. 제6장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ...33
    20. 제7장 참고문헌 ...34
  • 참고문헌

    1. 전체(0)
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