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보고서 상세정보

Array-CGH 시스템을 이용한 진단/예후 지표 및 환자 맞춤 치료법 개발
Develop diagnostic/prognostic marker system for HCC by using array-CGH

  • 과제명

    Array-CGH 시스템을 이용한 진단/예후 지표 및 환자 맞춤 치료법 개발

  • 주관연구기관

    카톨릭대학교

  • 보고서유형

    최종보고서

  • 발행국가

    대한민국

  • 언어

    한국어

  • 발행년월

    2010-05

  • 과제시작년도

    2009

  • 주관부처

    교육과학기술부

  • 사업 관리 기관

    한국연구재단
    National Research Foundation of Korea

  • 등록번호

    TRKO201000015302

  • 과제고유번호

    1345097936

  • 키워드

    간암,어레이-비교유전자보합법,공통 염색체변이구역,암유전자,맞춤의학Hepatoma,array-CGH,common alteration region (CAR),cancer related gene,Personalized medicine

  • DB 구축일자

    2013-04-18

  • 초록 


    ● Analysis the whole-genome copy number alterations using array-CGH for Korean HCC cases (normal-tumor pair)
    ● Define the comm...

    ● Analysis the whole-genome copy number alterations using array-CGH for Korean HCC cases (normal-tumor pair)
    ● Define the common alteration regions (CARs) in the HCCs
    ● Validation of the CARs by using genomic QPCR and real-time QRT-PCR
    ● Develop genomic QPCR kit and diagnostic array-chip for HCC
    ● Develop softwares to support prediction of HCC prognosis in the clinical field


    연구 목적
    ● 전장 유전체 분석기술인 array-CGH를 이용하여 DNA, RNA, protein이라는 생명체의 3대 축 중 RNA, proteomics 수준에서 발굴해온 간암 바이오마커와 보완적으로 DNA copy numbe...

    연구 목적
    ● 전장 유전체 분석기술인 array-CGH를 이용하여 DNA, RNA, protein이라는 생명체의 3대 축 중 RNA, proteomics 수준에서 발굴해온 간암 바이오마커와 보완적으로 DNA copy number 변이마커를 발굴하여 간암 예후예측의 실효성을 높임
    ● 임상친화성 간암예후예측용/치료효과 예측용 DNA칩 또는 검사키트 개발
    ● 임상적용을 지원하는 분석 시스템 개발
    연구 결과
    ● 한국인 간암에서 공통적으로 변하는 common alteration region (CAR) 발굴 (특허출원:한국,미국)
    -32종의 CAR 및 43종의 high level copy number alteration 마커 발굴
    -CAR 중 Gain of lq21.1-q32.1 (64.5%), 1q32.1-q44 (59.2%), 8q11.21-q24.3 (48.7%), Loss of 17p13.3-p12 (51.3%)은 한국인 간암의 45%이상에서 매우 빈번하게 발견되었으며 Mye, EIF3S3 유전자가 위치하는 8q11.1-8q24.3의 amplification은 76례의 간암 중 10례에서 공통적으로 발견되었음.
    ● Genomic qPCR기반 간암 예후예측 검사 kit 개발 (특허출원:한국)
    -발굴한 CAR 마커 중 간암의 예후를 가장 정확히 나타내는 조합을 룰 마이닝을 이용하요 발굴하였고 이를 바탕으로 간암 간암 예후예측 검사 kit을 설계하였음.
    ● 간암 예후예측용 DNA 어레이 시스템 개발
    -발굴한 CAR 마커 및 예후/임상 연관성 결과를 바탕으로 6093 probe를 디자인하고 이를 바탕으로 간암 예후예측용 DNA 어레이 시스템을 개발하였음 (http://ircgp.com/cnv_RND1.html).
    ● 간암 CAR에 속한 유전자들의 기능 연구 및 치료적용 가능성 확보
    -TPM3, KIF14 유전자의 간암 발암기전을 규명하였으며 이 유전자의 과발현 경로 차단시 간암성장이 지연됨을 확인하였음.
    ● 간암 염색체 변이 분석 및 간암 예후예측 검사 kit을 지원하는 소프트웨어 개발
    -Gene Set Enrichment Analysis for Genomic Alterations (GEAR:http://www.systemsbiology.co.kr/GEAR/)
    -CGHscape, http://www.ircgp.com/software/CGHscape


  • 목차(Contents) 

    1. 표지 ... 1
    2. 제출문 ... 6
    3. 보고서 초록 ... 8
    4. 요약문 ... 10
    5. SUMMARY ... 12
    6. CONTENTS ... 14
    7. 목차 ... 15
    8. 제1장 연구개발과제의 개요 ... 16
    9. 가. 연구개발의 목적 ... 16
    10. ...
    1. 표지 ... 1
    2. 제출문 ... 6
    3. 보고서 초록 ... 8
    4. 요약문 ... 10
    5. SUMMARY ... 12
    6. CONTENTS ... 14
    7. 목차 ... 15
    8. 제1장 연구개발과제의 개요 ... 16
    9. 가. 연구개발의 목적 ... 16
    10. 나. 연구개발의 필요성 ... 16
    11. 제2장 국내외 기술개발 현황 ... 19
    12. 1. 간암의 염색체 변이 연구 ... 19
    13. 2. 혈청 DNA 마커 ... 21
    14. 3. siRNA를 이용한 간암발암유전자의 발현억제연구 ... 21
    15. 4. RNA expression ... 21
    16. 제3장 연구개발수행 내용 및 결과 ... 22
    17. 가. 한국인 간암에서 공통적으로 변하는 common alteration region(CAR) 발굴 ... 22
    18. 나. 한국인 간암 CAR 마커의 기술권 확보 ... 27
    19. 다. Genomic qPCR기반 간암 예후예측 검사 kit 개발 ... 27
    20. 라. 간암 예후예측용 qPCR 검사법의 기술권 확보 ... 29
    21. 마. 간암 예후예측용 올리고어레이 개발 ... 30
    22. 바. 간암 CAR 속한 유전자들의 기능 연구 및 치료적용 가능성 ... 31
    23. 사 .간암 염색체 변이 분석 및 간암 예후예측 검사kit을 지원하는 소프트웨어 개발 ... 40
    24. 아. 연구 성과 ... 44
    25. 제4장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ... 46
    26. 가. 연구개발의 최종목표 ... 46
    27. 나. 연차별 연구개발 목표 및 내용 ... 46
    28. 다. 계획대비 달성도 ... 48
    29. 라. 제시된 연구목표중 중요도 순으로 목표(4-5개 정도)를 추출하고 가중치를 부여 ... 49
    30. 제5장 연구개발결과의 활용계획 ... 50
    31. 제6장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 52
    32. 제7장 참고문헌 ... 52
    33. 첨부 ... 53
    34. 끝페이지 ... 66
  • 참고문헌

    1. 전체(0)
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    3. 특허(0)
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