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보고서 상세정보

대용량 SNP칩을 이용한 외국 소 원산지 판별법 개발 연구
Development of analytical methods for identification of imported beef using high-density bovine SNP chip

  • 사업명

    식품안전연구개발

  • 과제명

    대용량 SNP칩을 이용한 외국 소 원산지 판별법 개발 연구

  • 주관연구기관

    (주)디엔에이링크

  • 연구책임자

    이종은

  • 보고서유형

    최종보고서

  • 발행국가

    대한민국

  • 언어

    한국어

  • 발행년월

    2006-12

  • 과제시작년도

    2006

  • 주관부처

    식품의약품안전청

  • 사업 관리 기관

    식품의약품안전청
    Korea Food & Drug Administration

  • 등록번호

    TRKO201000015757

  • 과제고유번호

    1470001851

  • 키워드

    SNP칩.수입육.한우.판별법.생체지표.SNP chip.Imported beef.Hanwoo.Analytical method.Biomarker.

  • DB 구축일자

    2013-04-18

  • 초록 


    The objective of this study is to discover SNP biomarkers for discriminating between Hanwoo Beef and imported beefs. We analyzed ...

    The objective of this study is to discover SNP biomarkers for discriminating between Hanwoo Beef and imported beefs. We analyzed 303 imported beefs with nine strains to discover SNP biomarkers by Affymetrix GeneChip® Bovine Mapping 10K SNP chips. The strains of imported beefs analyzed are as follows: Holstein, Jersey, Ayrshire, Guernsey, Angus, Charolais, Hereford, Brown Swiss, Simmental.
    Through Affymetrix GeneChip® Bovine Mapping 10K SNP chip we can analyze 10,000 SNPs on a chip. Approximately 92 percent of the SNPs for this chip were discovered by the Bovine Genome Sequencing Project. The remaining eight percent were obtained from CSIRO (Australia’s Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation) and beef cattle cross breeds. All SNPs in this panel have been validated in 84 unique bovine samples from six strains of cattle (Angus, Brahmin, Hereford, Holstein, Jersey, and Limousin). The average number of heterozygous markers is ~3,300 in both beef and dairy breeds.
    We developed 19 SNP biomarkers for discriminating using statistical analyses such as structure analysis and AIMs on chip data of 54 Hanwoo Beefs and 303 imported beefs. Now we are prepared with KFDA (Korea Food and Drug Administration) to make an application to the Patent Office.


    본 과제는 한우육과 수입육을 판별할 수 있는 SNP 바이오마커 (biomarker)의 발굴을 목적으로 한다. SNP 바이오마커의 발굴을 위해서 외국소 9품종 303두를 대상으로 Affymetrix사의 GeneChip® Bovine ...

    본 과제는 한우육과 수입육을 판별할 수 있는 SNP 바이오마커 (biomarker)의 발굴을 목적으로 한다. SNP 바이오마커의 발굴을 위해서 외국소 9품종 303두를 대상으로 Affymetrix사의 GeneChip® Bovine Mapping 10K SNP chip (PN 900870)을 이용하였다. 분석에 포함된 외국소의 9개 품종은 홀스타인 (Holstein), 저지 (Jersey), 에어셔 (Ayrshire), 건지 (Guernsey), 앵거스 (Angus), 샤롤레 (Charolais), 헤어포드 (Hereford), 브라운 스위스 (Brown Swiss), 심멘탈 (Simmental) 등이다.
    Affymetrix사의 GeneChip® Bovine Mapping 10K SNP chip은 하나의 chip에서 약 10,000개 SNP의 분석이 가능한 것으로 포함되어 있는 SNP 패널 (panel)의 92%는 Bovine Genome Sequencing Project를 통해 발굴된 것이며 나머지 8%는 CSIRO (Australia’s Commonwealth Scientific and Industrial Research Organization)로부터 얻어진 것이다. 앵거스 (Angus), 브라민 (Brahmin), 헤어퍼드 (Hereford), 홀스타인 (Holstein), 저지 (Jersey), 리무진 (Limousin) 등 6개 품종 84개의 소시료에서 선정된 SNP 패널로 구성되어 있으며 육우과 젖소를 구별하는 이형접합체 (heterozygous marker)가 평균 3300개로 구성되어 있다.
    바이오마커 발굴을 위해서 식품의약품안전청 신소재식품팀의 한우 54두에 대한 chip data와 본 연구를 통해 얻어진 외국소 303두에 대한 chip data를 바탕으로 Structure 등의 통계분석기법을 이용하여 품종정확성을 확인하고 AIMs 분석방법을 이용하여 품종구별을 위한 SNP 바이오마커 19개를 발굴하였으며 특허출원을 준비 중이다.
    본 연구를 통해 발굴된 SNP 바이오마커를 이용하여 식육 원산지 판별법을 개발하여 행정적 사후관리에 활용하고 식육 원산지 위장표시 방지를 위한 과학적 검증방법을 제시하여 식육 원산지 표시제 정착 유도 및 국민 신뢰를 확보함은 물론 음식점에서 한우외의 식육이 한우육으로 판매되는 무질서한 유통질서의 개선으로 소비자 권익보호와 영업자의 부당이득을 방지할 수 있을 것으로 기대된다.


  • 목차(Contents) 

    1. 표지 ...1
    2. 용역연구사업 연구결과보고서 ...2
    3. 연구과제제안서(RFP)...3
    4. 제출문 ...4
    5. 목차 ...5
    6. I. 연구개발결과 요약문 ...6
    7. 한글 요약문 ...6
    8. 영문 요약문 ...7
    9. II. 총괄연구개발과제 연구결과 ...8...
    1. 표지 ...1
    2. 용역연구사업 연구결과보고서 ...2
    3. 연구과제제안서(RFP)...3
    4. 제출문 ...4
    5. 목차 ...5
    6. I. 연구개발결과 요약문 ...6
    7. 한글 요약문 ...6
    8. 영문 요약문 ...7
    9. II. 총괄연구개발과제 연구결과 ...8
    10. 제1장 총괄연구개발과제의 최종 연구개발 목표 ...8
    11. 1.1 총괄연구개발과제의 목표...8
    12. 1.2 총괄연구개발과제의 목표달성도...9
    13. 1.3 국내.외 기술개발 현황...9
    14. 제2장 총괄연구개발과제의 최종 연구개발 내용 및 방법 ...11
    15. 2.1 연구수행내용...11
    16. 2.2 연구방법...12
    17. 2.3 통계분석...21
    18. 제3장 총괄연구개발과제의 최종 연구개발 결과 ...23
    19. 3.1 연구결과 기술...23
    20. 3.2 통계분석결과...25
    21. 제4장 총괄연구개발과제의 연구결과 고찰 및 결론 ...33
    22. 제5장 총괄연구개발과제의 연구성과 ...34
    23. 5.1 활용성과...34
    24. 5.2 활용계획...35
    25. 제6장 기타 중요변경사항 ...35
    26. 제7장 참고문헌 ...36
    27. 제8장 첨부서류 ...36
    28. 총괄 연구과제 요약...37
  • 참고문헌

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