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보고서 상세정보

Bioinformatics 기반 바이러스 변종 예측 및 검증기술 개발
Development of viral recombination prediction and validation technique using bioinformatics

  • 사업명

    글로벌프론티어사업

  • 과제명

    Bioinformatics 기반 바이러스 변종 예측 및 검증기술 개발

  • 주관연구기관

    한국생명공학연구원
    Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology

  • 연구책임자

    정대균

  • 참여연구자

    송대섭   윤선우   나운성  

  • 보고서유형

    1단계보고서

  • 발행국가

    대한민국

  • 언어

    한국어

  • 발행년월

    2015-06

  • 과제시작년도

    2014

  • 주관부처

    미래창조과학부
    KA

  • 사업 관리 기관

    (재)바이오나노헬스가드연구단
    Health-Global Ubiquitous Autonomous Rapid Detection

  • 등록번호

    TRKO201600000777

  • 과제고유번호

    1711014849

  • 키워드

    신종 바이러스.변종바이러스.재조합.인플루엔자.예측모델.New-emerging virus.Mutant virus.recombination.influenza.prediction model.

  • DB 구축일자

    2016-04-30

  • 초록 


    Influenza is a potentially life-threatening disease that annually accompanying 3 to 5 million infection and 250,000 to 500,000 de...

    Influenza is a potentially life-threatening disease that annually accompanying 3 to 5 million infection and 250,000 to 500,000 deaths worldwide. It also affects domestic poultry resulting in economic burden in the market. Today, however, despite extraordinary advances in development of countermeasures (diagnostics, therapeutics, and vaccines), the ease of world travel and increased global interdependence have added layers of complexity to containing these infectious diseases that affect not only the health but the economic stability of societies. Herein, we have performed wide range of studies on influenza: development of universal antibody and recombination pattern analysis, and basic study on influenza virus.
    In this project, we have developed universal influenza vaccine candidates containing influenza HA antigens in the context of recombinant protein. We performed establishment of recombination patterns by analyzing genetic dominance and functional balance of viral infection for effective preparedness of the emergence of new-emerging and mutants viruses. We also have analyzed validation of virological activity, pathogenicity, infection and transmission mode of new-emerging pandemic candidate virus after recombination patternizing using in vivo model such as mice, pigs and ferrets. Diverse influenza viruses were isolated from the fecal samples of wild migratory birds as well as pet dogs and domestic pigs then we have characterized the genetic and pathogenic properties of the viruses.


    ❍ 신·변종 바이러스 및 국가재난형 바이러스 대응 유용 유전자원 확보/가공
    : 다양한 인플루엔자 바이러스 분리주와 기타 국가재난형 바이러스 및 항원에 대한 재조합단백질을 제작
    ❍ 신·변종 인플루엔자 바이러스 혼합감염 패턴...

    ❍ 신·변종 바이러스 및 국가재난형 바이러스 대응 유용 유전자원 확보/가공
    : 다양한 인플루엔자 바이러스 분리주와 기타 국가재난형 바이러스 및 항원에 대한 재조합단백질을 제작
    ❍ 신·변종 인플루엔자 바이러스 혼합감염 패턴 규명
    : 다양한 재조합조합과 돌연변이 패턴으로 인해서 신·변종의 출현에 대한 emetic dominance과 functional balance에 의한 pattern 분석
    ❍ 조류, 포유류 인플루엔자 바이러스 재조합패턴 규명 및 데이터화
    : H3N8과 H3N2 바이러스의 재조합 패턴 규명 및 목적동물에서의 병원성 인자 규명
    ❍ 재조합바이러스의 고병원성 결정기 규명
    : 재조합 patternizing을 통해서 얻어진 신종출현바이러스 후보주의 virological activity, pathogenicity, infection 및 transmission mode등의 검증을 in vivo model에서 입증.
    ❍ Bioinformatics를 접목한 재조합바이러스의 pattern의 시뮬레이션 및 알고리즘분석을 통한 예측모델 개발


  • 목차(Contents) 

    1. 표지 ... 1
    2. 제 출 문 ... 2
    3. 보고서 요약서 ... 3
    4. 요 약 문 ... 4
    5. S U M M A R Y ... 6
    6. C O N T E N T S ... 7
    7. 목차 ... 9
    8. 제 1 장 연구개발과제의 개요 ... 11
    9. 제 2 장 국내외 기술개발...
    1. 표지 ... 1
    2. 제 출 문 ... 2
    3. 보고서 요약서 ... 3
    4. 요 약 문 ... 4
    5. S U M M A R Y ... 6
    6. C O N T E N T S ... 7
    7. 목차 ... 9
    8. 제 1 장 연구개발과제의 개요 ... 11
    9. 제 2 장 국내외 기술개발 현황 ... 14
    10. 제 3 장 연구개발 수행 내용 및 결과 ... 18
    11. 제 1절 신·변종 바이러스 및 국가재난형 바이러스 대응 유용유전자원 확보: Universal antigen 및 antibody 포함 ... 18
    12. 1. 인플루엔자 바이러스 검출을 위한 단클론 항체제작 ... 18
    13. 2. Universal antigen, antibody (monomeric & triple HA95)제작 ... 21
    14. 3. 동물모델에서의 Triple HA95의 항원성 및 면역원성 ... 23
    15. 제 2절 신·변종 인플루엔자 바이러스 혼합감염 패턴 규명 이용한병원성 인자 규명 ... 27
    16. 1. Equine H3N8과 canine H3N2 viral RNA의 추출 ... 27
    17. 2. Equine H3N8과 canine H3N2 viral RNA 유전정보의 일치성 여부 확인 ... 27
    18. 3. Equine H3N8과 canine H3N2 바이러스 혼합감염후의 바이러스 재조합 여부 확인 ... 28
    19. 4. Seasonal H3N2 및 equine H3N8 바이러스의 재조합 패턴 규명 ... 29
    20. 5. Seasonal H3N2 와 canine H3N2 재조합 패턴 규명 ... 30
    21. 6. 비글견에서의 인플루엔자 바이러스 병원성 인자 규명 ... 30
    22. 제 3절 바이러스 재조합 우선순위 결정요소 규명 ... 32
    23. 1. Canine H3N2 influenza virus 와 pandemic H1N1 혼합감염개체에서의 바이러스 분리 ... 32
    24. 2. Canine H3N2 influenza virus 와 pandemic H1N1 혼합감염시의 재조합 바이러스 유전정보 확보 ... 32
    25. 3. Canine H3N2 influenza virus 와 pandemic H1N1 간의 재조합 바이러스 우선순위 결정 ... 33
    26. 제 4절 재조합바이러스의 고병원성 결정기 규명, functional balance및 genetic dominance 규명 ... 35
    27. 1. 인플루엔자 바이러스 표준주 유전자 절편 클로닝 ... 35
    28. 2. 인플루엔자 바이러스 표준주 유전자 절편 유전형질주입 ... 36
    29. 3. 인플루엔자 바이러스 표준주 재조합 바이러스 특성 분석 ... 37
    30. 제 5절 Bioinformatics를 접목한 재조합바이러스의 pattern의 시뮬레이션 및 알고리즘분석을 통한 예측모델 개발 ... 38
    31. 1. 재조합 canine H3N2 인플루엔자 기원분석 ... 38
    32. 제 4 장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ... 41
    33. 제 5 장 연구개발결과의 활용계획 ... 42
    34. 제 6 장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 43
    35. 제 7 장 참고문헌 ... 45
    36. 끝페이지 ... 48
  • 참고문헌

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