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코호트 자료의 활용성 및 발전 방안 연구

  • 과제명

    코호트 자료의 활용성 및 발전 방안 연구

  • 주관연구기관

    국립암센터
    National Cancer Center

  • 연구책임자

    임민경

  • 참여연구자

    황상현  

  • 보고서유형

    최종보고서

  • 발행국가

    대한민국

  • 언어

    한국어

  • 발행년월

    2016-03

  • 과제시작년도

    2015

  • 주관부처

    보건복지부

  • 사업 관리 기관

    국립암센터
    National Cancer Center

  • 등록번호

    TRKO201600000942

  • 과제고유번호

    1465020127

  • 키워드

    코호트,생체시료,안정성,비교위험도cohort,biospecimen,stability,relative risk

  • DB 구축일자

    2016-05-14

  • 초록 


    Results
    - Maintaining of community cohort
    - Expansion of community cohort and feasibility of cohort study
    - Establishing...

    Results
    - Maintaining of community cohort
    - Expansion of community cohort and feasibility of cohort study
    - Establishing a support systems and utilizing cohort data and biological sample
    - Research carried out using a community cohort
    - Performing a pilot project for the enlarged cohort
    - Evaluation of stability of biological sample and biomarker detection
    - Provide protocols for quality of cohort specimens
    - Discovering potential quality-control biomarkers and providing plans of utilizing specimen
    - Evaluation for the association of methylated DNA in smoker


    연구의 목적 및 내용
    <최종목표>
    - 지역사회 코호트 운영, 현황 분석, 지속 운영, 향후 확대 타당성 점검, 생체시료 안정성 점검 등을 통하여 코호트 기반의 연구 활성화 방안 마련 및 지원 체계 확립
    <1세부과제목...

    연구의 목적 및 내용
    <최종목표>
    - 지역사회 코호트 운영, 현황 분석, 지속 운영, 향후 확대 타당성 점검, 생체시료 안정성 점검 등을 통하여 코호트 기반의 연구 활성화 방안 마련 및 지원 체계 확립
    <1세부과제목표>
    - 기존에 구축된 지역사회 코호트 유지 및 운영
    - 지역사회 코호트 지속 및 확대 구축 타당성 검토
    - 지역사회 코호트를 활용한 연구 수행 방안 마련
    - 코호트 자료 및 생체시료를 활용한 연구지원체계 확립
    - 코호트 확대 구축 방안 구체화를 위한 시범사업 수행
    <2세부과제목표>
    - 코호트 시료 내 필요 성분의 검출률 확인 및 검체 종류별 안정성 점검
    - 코호트 시료의 안정적 효율적 보관 및 활용 방안 모색
    - 코호트 시료를 활용한 질환 연관성 바이오마커의 발굴 및 활용성 검증
    - DNA 메틸화와 흡연과의 상관성 평가
    <1세부과제연구내용>
    - 국내외 코호트 활용 연구 현황 고찰
    - 한국중앙암등록본부 암등록자료 및 통계청 사망원인 자료 연계를 통한 코호트내 암발생 및 암사망 추적조사 실시 수행 후 암발생 및 사망 현황 등 관련 기초분석 실시
    - 소요 비용 및 인프라 대비 활용성을 고려한 코호트 유지 및 확대 방안 제시 및 그 타당성 점검
    - 국내외 연구 현황 및 전문가 합의에 의한 코호트 자료의 운영 및 활용 방안 마련
    - 수집 자료 현황 및 생체시료 활용성 점검 결과에 근거한 코호트 자료의 분양 및 활용 후 결과 환류 체계 마련
    - 코호트 기반 연구 활성화를 위한 연구 지원 체계 확립을 위한 지원조직 보완, 추적 조사 및 2차 자료 연계를 위한 관련 법‧규정 검토, 코호트 보유 정보와 생체시료에 대한 현황 파악 및 기본 자료 요약 제시
    - 코호트 확대 구축 방안 및 실행전략 수립을 위한 시범사업 가능성 검토 및 지역암센터 거점 일반인 대상 코호트 구축 시범사업 수행
    - 코호트 내 소변 시료를 활용한 직·간접흡연에 의한 국내 암발생 위험도 산출
    - 기존 유사 코호트와의 연계 활용을 통한 코호트 규모의 확대 방안 제시
    - 유전적 요인을 포함한 폐암 위험요인 위험도 산출을 위한 Nested Case-Control 연구 수행
    - 담도암 환자-대조군 대상 GWAS 연구를 통해 담도암 발생에 관여하는 유전자 탐색, 환경적 요인과 유전적 요인과의 상호작용 분석 연구
    - 코호트 자료를 활용하여 사회경제적 수준에 따른 흡연 관련 암의 발생률과 사망률 비교연구 수행
    - 코호트 내 5대 호발암에 대해 기존 알려진 위험요인의 암발생 위험도 분석
    <2세부과제연구내용>
    - 보관 중인 소변 내 주요 지표(예; 단백, nucleic acids)의 검출 및 안정성 평가
    - 13년간 –20 ℃ 냉동고에 보관된 소변 검체에 대해 proteomics, metabolomics, 그리고 개별 특이 단백인 cytokine에 대해 안정성을 분석함
    - 보관 중인 Buffy coat, Pack RBC,에서 DNA yield 점검 및 검출된 성분의 양과 질 평가
    - 현 코호트 시료 보관 처리 과정 검토 및 국내외 관련 SOP 고찰을 통해 효율적인 보관 및 관리 방안 탐색
    - 시료의 성분 검출 및 안정성 검사와 관련 문헌과 사례 고찰을 토대로 현 시료 보관 방식 이외의 보관 방안 검토
    - 코호트 시료 활용방안 탐색: 안정성이 검증된 코호트 시료를 이용한 암관련 바이오마커 문헌탐색 및 연구방안 제시
    - 1차 년도에 문헌검색을 통해 리뷰한 다양한 SOP 및 질 관리 프로토콜 검토 및 전문가 의견 수렴을 통하여 코호트 검체에 대한 체계적인 품질관리 프로토콜을 완성(표준품질관리지침서를 개발, 품질관리 기준 제시, 코호트 시료 정도관리 서식 개발 등 포함)
    - 문헌검색 결과 및 metabolomics, proteomics, cytokine assay 결과를 토대로 보관지표용 biomarker로 활용 가능한 물질을 선정 평가하고 관련 정도관리용 기준 설정
    - 코호트 소변 생체시료를 활용하여 방광암 위험요인 지표로서 소변 내 세포의 DNA methylation을 확인, 소변 내 HPV 감염율 조사 및 암과의 관련성 평가
    - 흡연연관 DNA 메틸화 측정
    - 흡연량 자가보고와의 상관성 평가
    - 소변 코티닌과의 상관성 분석

    연구개발성과
    <정량적 성과>
    구분 : 달성치/목표치 : 달성도(%)
    SCI 논문 편수 : 11/5 : 100
    IF 합 : 51.87/20 : 100
    기타 성과 : 분자진단에서 자성 입자를 이용한 핵산 검출법 및 검사 키트 특허

    <정성적 성과>
    - 코호트 자료 및 생체시료 현황 요약 및 정보 지침서 코호트 생체시료의 품질관리지침서
    - 단백체 6종에 대한 Proteomics 검사(혈청과 혈장 총 590개) 등 생체시효 안정성 활용성 검토 결과
    - 향후 코호트 운영과 활용을 위한 체계 제안 가능
    - 향후 장기보관이 필요한 코호트 생체시료의 안정적 보관과 질점검 방안 제시 가능

    연구개발성과의 활용계획 (기대효과)
    <1세부>
    - 코호트 연구 자료 및 생체시료를 활용한 연구 지원체계를 구축함으로써 암관련 연구 활성화는 물론 암관련 연구 자료 수집과 소요 시간 및 비용 절감과 코호트 기반의 연구 재료 제공을 통하여 연구 결과로 산출될 근거의 수준 향상을 도모할 수 있을 것임
    - 코호트 연구 자료의 효율적 관리 및 운영과 관련 연구지원 체계 마련을 통하여 한국인을 대상으로 한 암관련 위험요인의 위험도 산출은 물론 다양한 암 관련 연구의 활성화가 가능 할 것이며, 이들 연구 결과는 궁극적으로 암예방 및 관리를 위한 근거 자료로 활용 될 수 있을 것임
    - 유전적 요인, 환경적 요인, 생활습관요인 등 폐암 관련 위험요인에 대한 포괄적 위험도 산출 및 위험 요인간 상호작용 확인이 가능할 것이며, 한국인 대상 위험도 산출 결과를 토대로 한 위험요인별 인구집단 기여위험도 산출이 가능할 것임
    <2세부>
    - 보관 검체의 안정성을 평가함으로써 보관검체를 이용한 연구의 신뢰성 확보
    - 채혈-운송-처리-보관에 이르는 프로세스의 체계화 및 정비
    - 검체보관등 바이오뱅크 관련된 지식 확대 및 전문인력 양성
    - 보관검체를 활용한 바이오마커 발굴 검증의 중개 연구의 발전
    - 바이오마커의 평가 및 상용화에 걸리는 시간을 단축시킬 수 있음
    - 보관 유지비용의 효과적인 관리 또는 절감
    - 바이오뱅크의 정도관리에 대한 수준 향상 및 선도
    - 안정성이 확인된 코호트 시료를 활용한 biomarker 연구 시행의 사례 및 근거 제시


  • 목차(Contents) 

    1. 표지 ... 1
    2. 최종보고서[기관고유연구사업] ... 2
    3. 국문 요약문 ... 3
    4. 영문 요약문 ... 6
    5. 목차 ... 7
    6. I. 총괄과제 ... 8
    7. 1. 연구개발과제의 개요 ... 9
    8. 2. 국내외 기술개발 현황 ... 10
    9. 3. 연구수행 내용 ...
    1. 표지 ... 1
    2. 최종보고서[기관고유연구사업] ... 2
    3. 국문 요약문 ... 3
    4. 영문 요약문 ... 6
    5. 목차 ... 7
    6. I. 총괄과제 ... 8
    7. 1. 연구개발과제의 개요 ... 9
    8. 2. 국내외 기술개발 현황 ... 10
    9. 3. 연구수행 내용 및 결과 ... 12
    10. 4. 목표달성도 및 관련분야 기여도 ... 38
    11. 5. 연구결과의 활용계획 ... 40
    12. 6. 연구과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 41
    13. 7. 연구개발과제의 대표적 연구실적 ... 41
    14. 8. 참여연구원 현황 ... 44
    15. 9. 기타사항 ... 45
    16. 10. 참고문헌 ... 45
    17. II. 제1세부과제 ... 47
    18. 1. 연구개발과제의 개요 ... 48
    19. 2. 국내외 기술개발 현황 ... 49
    20. 3. 연구수행 내용 및 결과 ... 61
    21. 4. 목표달성도 및 관련분야 기여도 ... 220
    22. 5. 연구결과의 활용계획 ... 221
    23. 6. 연구과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 222
    24. 7. 연구개발과제의 대표적 연구실적 ... 224
    25. 8. 참여연구원 현황 ... 226
    26. 9. 기타사항 ... 226
    27. 10. 참고문헌 ... 227
    28. III. 제2세부과제 ... 228
    29. 1. 연구개발과제의 개요 ... 229
    30. 2. 국내외 기술개발 현황 ... 229
    31. 3. 연구수행 내용 및 결과 ... 230
    32. 4. 목표달성도 및 관련분야 기여도 ... 312
    33. 5. 연구결과의 활용계획 ... 312
    34. 6. 연구과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 313
    35. 7. 연구개발과제의 대표적 연구실적 ... 313
    36. 8. 참여연구원 현황 ... 313
    37. 9. 기타사항 ... 314
    38. 10. 참고문헌 ... 314
    39. 부록 ... 316
    40. 부록 1. 간흡충 재검사 안내문 ... 317
    41. 부록 2. 간흡충 재검사 결과 안내문 ... 318
    42. 부록 3. 코딩지침서 ... 319
    43. 부록 4. 인체유래물은행 관련 규정 상세 정보 ... 414
    44. 부록 5. 관련법 : 국민건강보험법 ... 424
    45. 끝페이지 ... 425
  • 참고문헌

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